More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2827 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1625  putative transposase A protein  100 
 
 
133 aa  262  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2827  putative transposase A protein  100 
 
 
132 aa  262  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897465  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1736  putative transposase A protein  99.24 
 
 
132 aa  261  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0757752  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1734  hypothetical protein  93.94 
 
 
132 aa  253  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1513  hypothetical protein  93.94 
 
 
132 aa  253  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272335  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0181  hypothetical protein  93.94 
 
 
132 aa  253  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000811321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1069  hypothetical protein  93.94 
 
 
132 aa  253  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0985  hypothetical protein  93.94 
 
 
132 aa  253  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1756  hypothetical protein  93.94 
 
 
132 aa  253  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1909  hypothetical protein  93.94 
 
 
132 aa  253  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.555093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2570  ISBm1, transposase orfA, interruption-N  93.94 
 
 
132 aa  253  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1469  hypothetical protein  96.21 
 
 
133 aa  234  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.270424  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1762  hypothetical protein  96.21 
 
 
133 aa  234  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695632  normal  0.0625583 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1415  hypothetical protein  96.21 
 
 
133 aa  234  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.631309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4634  hypothetical protein  96.21 
 
 
133 aa  234  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578945  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1493  hypothetical protein  96.21 
 
 
133 aa  234  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1012  hypothetical protein  96.21 
 
 
133 aa  234  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1375  hypothetical protein  96.21 
 
 
133 aa  234  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1482  hypothetical protein  60.94 
 
 
210 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1340  putative transposase  60.94 
 
 
229 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1347  putative transposase  60.94 
 
 
229 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2884  hypothetical protein  60.47 
 
 
223 aa  154  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1648  hypothetical protein  56.12 
 
 
334 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1451  hypothetical protein  56.12 
 
 
334 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0271  hypothetical protein  56.12 
 
 
334 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.852206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0303  hypothetical protein  56.12 
 
 
334 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2626  transposase  56.12 
 
 
334 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0920  hypothetical protein  56.12 
 
 
373 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2488  hypothetical protein  56.12 
 
 
334 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1055  putative transposase A-like protein  56.2 
 
 
438 aa  140  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.733462  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3818  hypothetical protein  54.41 
 
 
313 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.546084 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3706  hypothetical protein  54.41 
 
 
313 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4545  hypothetical protein  54.41 
 
 
313 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5544  hypothetical protein  53.68 
 
 
313 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152908  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2278  hypothetical protein  53.68 
 
 
313 aa  140  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3721  hypothetical protein  53.68 
 
 
314 aa  139  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.313369  normal  0.0880548 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0541  hypothetical protein  55.64 
 
 
390 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2249  putative transposase A-like protein  55.15 
 
 
401 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.909446  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1953  putative transposase A-like protein  55.15 
 
 
391 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.520795 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4921  hypothetical protein  52.21 
 
 
310 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0271882 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7183  putative transposase A-like protein  53.68 
 
 
283 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173089  normal  0.690368 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6232  putative transposase A-like protein  40.74 
 
 
290 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.489662 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1394  hypothetical protein  45 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.997905  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4653  hypothetical protein  45 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385837  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1434  hypothetical protein  44 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00387753  normal  0.0246951 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1488  hypothetical protein  45.05 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187879  hitchhiker  0.000281103 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1512  hypothetical protein  45.05 
 
 
136 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1032  hypothetical protein  45.05 
 
 
136 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703419  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1743  hypothetical protein  45.78 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  41.76 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  41.76 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  42.7 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1755  hypothetical protein  40.66 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1494  hypothetical protein  40.66 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0162  hypothetical protein  40.66 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1777  hypothetical protein  40.66 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1047  hypothetical protein  40.66 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1004  hypothetical protein  40.66 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0627317  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1928  hypothetical protein  40.66 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.643232  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2552  hypothetical protein  35.77 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5541  putative insertion element transposase  44.59 
 
 
87 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73359  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6770  putative transposase  40.74 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0648258  normal  0.255889 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2785  putative transposase  39.29 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  39.51 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  37.04 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6488  transposase  34.52 
 
 
103 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  47.73 
 
 
278 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  39.66 
 
 
277 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  37.04 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  35.8 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  39.73 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  39.73 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  39.73 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  39.76 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  39.76 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  39.73 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  39.76 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  39.73 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  35.8 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3887  transposase and inactivated derivatives-like  40.23 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.14 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  42.39 
 
 
276 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  42.39 
 
 
276 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  37.04 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.73 
 
 
252 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  37.04 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  37.04 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  37.04 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  37.04 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  35.71 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  38.46 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  35.71 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  35.8 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.04 
 
 
281 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  33.62 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  35.8 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  35.8 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  31.4 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4299  transposase  36.11 
 
 
197 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  37.04 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>