More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4299 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007959  Nham_4299  transposase  100 
 
 
197 aa  408  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  69.12 
 
 
275 aa  202  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  60.29 
 
 
276 aa  184  9e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  64.71 
 
 
275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  60 
 
 
268 aa  181  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  58.17 
 
 
293 aa  177  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  60 
 
 
268 aa  177  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  60.29 
 
 
274 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  60.29 
 
 
278 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  60.29 
 
 
278 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  60.29 
 
 
278 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  60.29 
 
 
278 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  60.29 
 
 
278 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  60.29 
 
 
278 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  60.29 
 
 
278 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  60.29 
 
 
278 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  60.29 
 
 
278 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  60.29 
 
 
278 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  60.29 
 
 
278 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  60.29 
 
 
278 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  57.04 
 
 
270 aa  167  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  57.04 
 
 
270 aa  167  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  57.04 
 
 
276 aa  167  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  55.56 
 
 
273 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  55.56 
 
 
273 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  55.56 
 
 
270 aa  164  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  52.59 
 
 
270 aa  153  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  52.59 
 
 
270 aa  153  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  52.59 
 
 
270 aa  153  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  52.59 
 
 
270 aa  153  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  52.59 
 
 
270 aa  153  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  52.59 
 
 
270 aa  153  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  52.59 
 
 
270 aa  153  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  52.59 
 
 
270 aa  153  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  57.78 
 
 
278 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  49.64 
 
 
278 aa  141  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1516  transposase  50.78 
 
 
155 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000901258  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3887  transposase and inactivated derivatives-like  48.06 
 
 
159 aa  130  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3993  hypothetical protein  46.88 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  56.48 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  51.24 
 
 
270 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  56.19 
 
 
254 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  60.67 
 
 
224 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  49.59 
 
 
274 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  41.48 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
298 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1892  hypothetical protein  45.3 
 
 
129 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
274 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  49.17 
 
 
274 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3379  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
285 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0073  transposase  43.75 
 
 
127 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0080  transposase  44.64 
 
 
127 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0800  transposase  44.64 
 
 
127 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1018  transposase  44.64 
 
 
127 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1364  transposase  44.64 
 
 
127 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906746  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2641  transposase  44.64 
 
 
127 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3317  transposase  44.64 
 
 
127 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000684443  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3800  transposase  44.64 
 
 
127 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176127  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  45.9 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  48.03 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  43.7 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  47.54 
 
 
274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2358  transposase, IS4 family protein  62.37 
 
 
235 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  47.06 
 
 
274 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  47.24 
 
 
274 aa  112  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  46.46 
 
 
265 aa  111  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  47.24 
 
 
274 aa  111  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  47.24 
 
 
274 aa  111  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  47.24 
 
 
274 aa  111  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  47.24 
 
 
274 aa  111  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  47.24 
 
 
274 aa  111  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  46.67 
 
 
274 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  47.24 
 
 
274 aa  111  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  47.24 
 
 
274 aa  111  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  47.24 
 
 
274 aa  111  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  41.18 
 
 
251 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0169  transposase  44.34 
 
 
127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103763  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  41.18 
 
 
251 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3641  transposase  42.86 
 
 
127 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  41.18 
 
 
251 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4119  transposase (IS12528)  44.93 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  41.18 
 
 
251 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  41.18 
 
 
251 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0651195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>