More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3788 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  100 
 
 		 265 aa  535  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  96.23 
 
 		 265 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  96.6 
 
 		 270 aa  511  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  88.68 
 
 		 274 aa  484  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  88.68 
 
 		 274 aa  484  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  88.68 
 
 		 274 aa  484  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  88.68 
 
 		 274 aa  484  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  88.68 
 
 		 274 aa  484  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  88.3 
 
 		 274 aa  481  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  88.3 
 
 		 274 aa  483  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  88.3 
 
 		 274 aa  483  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  88.3 
 
 		 274 aa  481  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  70.08 
 
 		 274 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  70.08 
 
 		 274 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  70.08 
 
 		 274 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  68.94 
 
 		 274 aa  363  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  69.7 
 
 		 274 aa  363  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  69.7 
 
 		 274 aa  363  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  68.94 
 
 		 274 aa  360  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  69.96 
 
 		 280 aa  360  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4117  transposase, IS4  93.38 
 
 		 145 aa  259  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4119  transposase (IS12528)  96.9 
 
 		 158 aa  257  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  50.19 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  50.19 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  50.19 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  50.19 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  50.19 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  50.19 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  50.19 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  50.19 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  50.19 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  50.19 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  50.19 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  50.19 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  47.13 
 
 		 274 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  46.36 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  47.89 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  47.89 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  46.39 
 
 		 268 aa  221  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  46.39 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  46.39 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  46.39 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  46.39 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  46.39 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  46.39 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  46.39 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  46.39 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  45.63 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  46.06 
 
 		 276 aa  215  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  49.43 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  46.77 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  45.77 
 
 		 270 aa  205  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  45.77 
 
 		 270 aa  205  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  44.49 
 
 		 275 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  46 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  44.02 
 
 		 308 aa  202  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  40.22 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  44.57 
 
 		 270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  46.88 
 
 		 224 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  44.09 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  44.09 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  44.09 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  38.98 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  42.68 
 
 		 274 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  39.84 
 
 		 284 aa  178  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  39.84 
 
 		 284 aa  178  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  38.52 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  40.78 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  39.45 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  39.46 
 
 		 287 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  39.46 
 
 		 287 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  39.46 
 
 		 287 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0151  transposase, IS4  40.32 
 
 		 250 aa  175  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  37.5 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  43.82 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  38.87 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  37.31 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3379  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2540  transposase, IS4  40.08 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2707  transposase, IS4  40.08 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4006  transposase, IS4  40.08 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>