More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3379 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3379  transposase IS4 family protein  100 
 
 
285 aa  584  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  88.42 
 
 
285 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  81.05 
 
 
298 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
270 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  42 
 
 
270 aa  188  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  42 
 
 
270 aa  188  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  40.07 
 
 
268 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  39.33 
 
 
268 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  41.6 
 
 
270 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  41.6 
 
 
270 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  41.6 
 
 
270 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  41.6 
 
 
270 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  41.6 
 
 
270 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  41.6 
 
 
270 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  41.6 
 
 
270 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  41.6 
 
 
270 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  37.59 
 
 
273 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  37.59 
 
 
273 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  38.26 
 
 
274 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  38.26 
 
 
274 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  38.26 
 
 
274 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  38.26 
 
 
274 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  38.26 
 
 
274 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  38.26 
 
 
274 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  38.26 
 
 
274 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  38.26 
 
 
274 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  38.26 
 
 
274 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  36.74 
 
 
278 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  36.74 
 
 
278 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  36.74 
 
 
278 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  36.74 
 
 
278 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  36.74 
 
 
278 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  36.74 
 
 
278 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  36.74 
 
 
278 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  36.74 
 
 
278 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  36.74 
 
 
278 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  36.74 
 
 
278 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  36.74 
 
 
278 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  36.74 
 
 
278 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  47.64 
 
 
276 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  34.93 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  33.96 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  36.57 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  36.36 
 
 
265 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  34.43 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  34.43 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  34.43 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  34.67 
 
 
274 aa  161  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  34.31 
 
 
274 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  34.31 
 
 
274 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  35.18 
 
 
265 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  33.81 
 
 
280 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  37.77 
 
 
278 aa  158  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  35.57 
 
 
270 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  36.03 
 
 
275 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  33.33 
 
 
274 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  33.45 
 
 
293 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  43.14 
 
 
224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  36.74 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  38.37 
 
 
254 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  37.4 
 
 
251 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  35.74 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1298  transposase IS4 family protein  32.81 
 
 
269 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1109  transposase, IS4  36.05 
 
 
278 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138434  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2037  transposase, IS4  36.05 
 
 
278 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362395  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2540  transposase, IS4  36.05 
 
 
278 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2707  transposase, IS4  36.05 
 
 
278 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4006  transposase, IS4  36.05 
 
 
278 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2080  transposase, IS4  36.05 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.382451  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  33.73 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  34.34 
 
 
287 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  34.34 
 
 
287 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  34.34 
 
 
287 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  36.05 
 
 
271 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  33.85 
 
 
275 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  31.02 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  33.08 
 
 
283 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  32.45 
 
 
279 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  32.45 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  32.45 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  30.98 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  30.98 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0651195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>