More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4093 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  100 
 
 		 254 aa  512  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  97.59 
 
 		 251 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  72.06 
 
 		 270 aa  352  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  72.06 
 
 		 270 aa  352  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  72.06 
 
 		 270 aa  352  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  72.06 
 
 		 270 aa  352  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  72.06 
 
 		 270 aa  352  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  72.06 
 
 		 270 aa  352  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  72.06 
 
 		 270 aa  352  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  72.06 
 
 		 270 aa  352  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  73.71 
 
 		 224 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  67.61 
 
 		 268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  68.42 
 
 		 268 aa  335  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  62.2 
 
 		 270 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  63.97 
 
 		 270 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  63.97 
 
 		 270 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  54.18 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  54.18 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  50.6 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  50.59 
 
 		 275 aa  231  9e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  50 
 
 		 278 aa  221  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  50 
 
 		 278 aa  221  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  50 
 
 		 278 aa  221  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  50 
 
 		 278 aa  221  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  61.99 
 
 		 276 aa  222  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  50 
 
 		 278 aa  221  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  50 
 
 		 278 aa  221  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  50 
 
 		 278 aa  221  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  50 
 
 		 278 aa  221  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  50 
 
 		 278 aa  221  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  50 
 
 		 278 aa  221  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  50 
 
 		 278 aa  221  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  50 
 
 		 278 aa  221  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  48.5 
 
 		 278 aa  210  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  46.77 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  45.7 
 
 		 293 aa  204  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  46.18 
 
 		 274 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  46.18 
 
 		 274 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  46.18 
 
 		 274 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  44.84 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  46.18 
 
 		 274 aa  201  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  46.18 
 
 		 274 aa  201  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  45.38 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  45.56 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  45.56 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  45.56 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  45.56 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  45.56 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  45.56 
 
 		 265 aa  198  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  45.56 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  45.56 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  45.56 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  45.99 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  46.18 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  44.98 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  45.16 
 
 		 274 aa  195  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2358  transposase, IS4 family protein  46.91 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  45.97 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  43.45 
 
 		 271 aa  192  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  45.42 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  42.63 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  45.85 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  45.24 
 
 		 275 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  41.25 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  41.25 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  41.25 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  41.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  46.49 
 
 		 274 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  40.24 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  38.91 
 
 		 251 aa  168  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  38.91 
 
 		 251 aa  168  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  38.91 
 
 		 251 aa  168  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  38.91 
 
 		 251 aa  168  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  38.91 
 
 		 251 aa  168  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  39.77 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  41.45 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  41.45 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  40.87 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  37.35 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  41.88 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  39.41 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  41.88 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  41.88 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>