More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6779 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  100 
 
 
280 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  43.45 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  46.04 
 
 
275 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  42.7 
 
 
308 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  41.79 
 
 
295 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  41.79 
 
 
295 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  41.79 
 
 
295 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  42.07 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  42.07 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  42.07 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  42.07 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  42.07 
 
 
274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  42.07 
 
 
274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  41.3 
 
 
278 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  41.3 
 
 
278 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  41.3 
 
 
278 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  41.3 
 
 
278 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  41.3 
 
 
278 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  41.3 
 
 
278 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  41.3 
 
 
278 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  41.3 
 
 
278 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  41.3 
 
 
278 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  41.3 
 
 
278 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  41.3 
 
 
278 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  41.3 
 
 
278 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  40.88 
 
 
270 aa  198  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  43.48 
 
 
274 aa  198  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  39.63 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  44.44 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  44.44 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  41.33 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  42.65 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  41.61 
 
 
280 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  42.65 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  42.44 
 
 
270 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  42.44 
 
 
270 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  42.44 
 
 
270 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  42.44 
 
 
270 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  42.44 
 
 
270 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  42.44 
 
 
270 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  42.44 
 
 
270 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  42.44 
 
 
270 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
266 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
266 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
266 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
266 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
266 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
266 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
266 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
266 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
266 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
266 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
266 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
266 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
266 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
266 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  41.76 
 
 
275 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  43.33 
 
 
270 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  40 
 
 
276 aa  188  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  39.44 
 
 
274 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  37.5 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  37.64 
 
 
275 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  37.15 
 
 
284 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  37.15 
 
 
284 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  39.08 
 
 
274 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  37.78 
 
 
274 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  37.78 
 
 
274 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  37.78 
 
 
274 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  37.78 
 
 
274 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  37.78 
 
 
274 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  37.78 
 
 
274 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  38.85 
 
 
274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  37.78 
 
 
274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  37.78 
 
 
274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  38.71 
 
 
274 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  38.52 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  38.52 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  38.52 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  38.52 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  38.52 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  37.72 
 
 
283 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  38.06 
 
 
273 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  38.06 
 
 
273 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  38.95 
 
 
274 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  38.55 
 
 
294 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  38.52 
 
 
265 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  37.41 
 
 
274 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  42.28 
 
 
278 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0151  transposase, IS4  41.35 
 
 
250 aa  176  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  38.73 
 
 
274 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  39.58 
 
 
287 aa  175  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  39.58 
 
 
287 aa  175  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  39.58 
 
 
287 aa  175  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  38.38 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  38.13 
 
 
278 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2707  transposase, IS4 family protein  37.23 
 
 
270 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2939  transposase, IS4 family protein  37.23 
 
 
270 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393582  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3263  transposase, IS4 family protein  37.23 
 
 
270 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3765  transposase, IS4 family protein  37.23 
 
 
270 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4617  transposase, IS4 family protein  37.23 
 
 
270 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>