More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3690 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
274 aa  568  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  99.27 
 
 
274 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  94.16 
 
 
274 aa  500  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  88.32 
 
 
270 aa  502  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  93.8 
 
 
274 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  93.43 
 
 
274 aa  494  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  92.67 
 
 
274 aa  484  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  92.67 
 
 
274 aa  484  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  91.24 
 
 
274 aa  484  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  90.15 
 
 
274 aa  478  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  44.24 
 
 
278 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  44.24 
 
 
278 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  44.24 
 
 
278 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  44.24 
 
 
278 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  44.24 
 
 
278 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  44.24 
 
 
278 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  44.24 
 
 
278 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  44.24 
 
 
278 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  44.24 
 
 
278 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  44.24 
 
 
278 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  44.24 
 
 
278 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  44.24 
 
 
278 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1708  transposase IS4 family protein  42.69 
 
 
273 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  47.09 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  47.09 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  43.85 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  42.25 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  46.22 
 
 
275 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  40.3 
 
 
274 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  42.12 
 
 
275 aa  188  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  40.47 
 
 
273 aa  188  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  40.47 
 
 
273 aa  188  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  39.58 
 
 
280 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  39.15 
 
 
275 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  40.66 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  37.69 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  37.69 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  40.66 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  37.69 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  39.53 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  41.63 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  41.25 
 
 
268 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  40.84 
 
 
278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  44.25 
 
 
274 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  42.6 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  42.6 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  42.6 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  42.6 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  42.6 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  42.6 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  42.6 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  42.6 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  35.77 
 
 
294 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  40.31 
 
 
251 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  40.31 
 
 
251 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  40.31 
 
 
251 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  40.31 
 
 
251 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  40.31 
 
 
251 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  41.45 
 
 
254 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  40.08 
 
 
251 aa  168  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  38.95 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  44.04 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  38.66 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  38.66 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  38.66 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  43.3 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  38.66 
 
 
274 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  38.66 
 
 
274 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0151  transposase, IS4  39.27 
 
 
250 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  36.94 
 
 
283 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  36.78 
 
 
293 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  37.59 
 
 
274 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  38.24 
 
 
280 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  37.59 
 
 
274 aa  158  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  37.59 
 
 
274 aa  158  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  37.59 
 
 
274 aa  158  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  37.59 
 
 
274 aa  158  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  37.59 
 
 
274 aa  158  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  37.59 
 
 
274 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  37.59 
 
 
274 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  36.84 
 
 
265 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  46.86 
 
 
276 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  37.92 
 
 
274 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  37.22 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  38.11 
 
 
266 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  38.11 
 
 
266 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  38.11 
 
 
266 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  38.11 
 
 
266 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  38.11 
 
 
266 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  38.11 
 
 
266 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  38.11 
 
 
266 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  38.11 
 
 
266 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  38.11 
 
 
266 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  38.11 
 
 
266 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  38.11 
 
 
266 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  38.11 
 
 
266 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  38.11 
 
 
266 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  38.11 
 
 
266 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2390  transposase IS4 family protein  35.06 
 
 
274 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3747  transposase IS4 family protein  36.09 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>