More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4119 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007959  Nham_4119  transposase (IS12528)  100 
 
 
158 aa  321  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  96.9 
 
 
265 aa  258  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  96.9 
 
 
265 aa  257  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  93.48 
 
 
270 aa  254  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  85.51 
 
 
274 aa  251  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  85.51 
 
 
274 aa  251  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  85.51 
 
 
274 aa  251  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  85.51 
 
 
274 aa  251  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  85.51 
 
 
274 aa  251  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  85.51 
 
 
274 aa  251  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  85.51 
 
 
274 aa  251  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  85.51 
 
 
274 aa  251  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  84.78 
 
 
274 aa  248  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  60.42 
 
 
274 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  59.72 
 
 
274 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  60.42 
 
 
274 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  60.42 
 
 
274 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  62.32 
 
 
274 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  59.72 
 
 
274 aa  157  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  59.72 
 
 
274 aa  157  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  59.03 
 
 
280 aa  154  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  47.65 
 
 
270 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  47.65 
 
 
270 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  47.65 
 
 
270 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  47.65 
 
 
270 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  47.65 
 
 
270 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  47.65 
 
 
270 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  47.65 
 
 
270 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  47.65 
 
 
270 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  45.7 
 
 
268 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  45.03 
 
 
268 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  44.3 
 
 
270 aa  120  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  44.3 
 
 
276 aa  120  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  44.3 
 
 
270 aa  120  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  45.83 
 
 
275 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  43.75 
 
 
274 aa  117  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  45.14 
 
 
276 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  42.41 
 
 
270 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  43.12 
 
 
273 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  43.12 
 
 
273 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  49.59 
 
 
251 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  49.59 
 
 
254 aa  110  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3887  transposase and inactivated derivatives-like  41.52 
 
 
159 aa  110  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  46.21 
 
 
278 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  46.21 
 
 
278 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  46.21 
 
 
278 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  46.21 
 
 
278 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  46.21 
 
 
278 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  46.21 
 
 
278 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4299  transposase  44.93 
 
 
197 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  46.21 
 
 
278 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  46.21 
 
 
278 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  46.21 
 
 
278 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  46.21 
 
 
278 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  46.21 
 
 
278 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  46.21 
 
 
278 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  39.04 
 
 
308 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3993  hypothetical protein  43.51 
 
 
202 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  42.19 
 
 
274 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 
250 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  38.96 
 
 
298 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  50 
 
 
224 aa  99.4  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  38.41 
 
 
293 aa  97.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  40.77 
 
 
275 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0151  transposase, IS4  38.64 
 
 
250 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  41.6 
 
 
280 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  42.86 
 
 
278 aa  95.5  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0169  transposase  39.13 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103763  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1516  transposase  42.11 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000901258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  40.62 
 
 
270 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  40.16 
 
 
294 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  47.33 
 
 
278 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
275 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0080  transposase  37.39 
 
 
127 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0800  transposase  37.39 
 
 
127 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1018  transposase  37.39 
 
 
127 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1364  transposase  37.39 
 
 
127 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906746  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2641  transposase  37.39 
 
 
127 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3317  transposase  37.39 
 
 
127 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000684443  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3800  transposase  37.39 
 
 
127 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176127  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1892  hypothetical protein  44.04 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0073  transposase  40.37 
 
 
127 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>