More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4117 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4117  transposase, IS4  100 
 
 		 145 aa  291  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  94.85 
 
 		 270 aa  265  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  93.38 
 
 		 265 aa  259  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  91.91 
 
 		 265 aa  258  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  86.03 
 
 		 274 aa  241  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  86.03 
 
 		 274 aa  241  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  86.03 
 
 		 274 aa  241  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  86.03 
 
 		 274 aa  241  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  86.03 
 
 		 274 aa  241  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  86.03 
 
 		 274 aa  240  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  85.29 
 
 		 274 aa  239  7.999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  85.29 
 
 		 274 aa  239  7.999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  85.29 
 
 		 274 aa  238  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  75 
 
 		 274 aa  216  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  75 
 
 		 274 aa  216  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  75 
 
 		 274 aa  216  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  75 
 
 		 274 aa  216  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  75 
 
 		 274 aa  216  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  72.79 
 
 		 274 aa  213  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  74.07 
 
 		 280 aa  213  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  72.79 
 
 		 274 aa  210  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  48.89 
 
 		 278 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  48.89 
 
 		 278 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  48.89 
 
 		 278 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  48.89 
 
 		 278 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  48.89 
 
 		 278 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  48.89 
 
 		 278 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  48.89 
 
 		 278 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  48.89 
 
 		 278 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  48.89 
 
 		 278 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  48.89 
 
 		 278 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  48.89 
 
 		 278 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  48.89 
 
 		 278 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  45.19 
 
 		 274 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  49.26 
 
 		 278 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  45.26 
 
 		 275 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  45.19 
 
 		 273 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  45.19 
 
 		 273 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  42.11 
 
 		 275 aa  111  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2358  transposase, IS4 family protein  42.22 
 
 		 235 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  42.54 
 
 		 254 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  44 
 
 		 276 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  41.04 
 
 		 251 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  40.48 
 
 		 293 aa  101  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  41.04 
 
 		 268 aa  100  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  41.04 
 
 		 268 aa  99.8  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  42.54 
 
 		 224 aa  97.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  42.54 
 
 		 270 aa  97.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  42.54 
 
 		 270 aa  97.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  42.54 
 
 		 270 aa  97.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  42.54 
 
 		 270 aa  97.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  42.54 
 
 		 270 aa  97.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  42.54 
 
 		 270 aa  97.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  42.54 
 
 		 270 aa  97.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  42.54 
 
 		 270 aa  97.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  40.8 
 
 		 284 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  40.8 
 
 		 284 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  44.53 
 
 		 308 aa  96.7  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  39.39 
 
 		 283 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 		 295 aa  96.7  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 		 295 aa  96.7  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 		 295 aa  96.7  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 279 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 275 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1515  IS4 family transposase  38.66 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00015813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  41.13 
 
 		 278 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  41.79 
 
 		 270 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  41.79 
 
 		 270 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  40.15 
 
 		 287 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  40.15 
 
 		 287 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  40.15 
 
 		 287 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  37.1 
 
 		 298 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  39.85 
 
 		 270 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02776  ISXo3 transposase ORF B  36.3 
 
 		 158 aa  85.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03511  transposase and inactivated derivatives  36.36 
 
 		 243 aa  84.3  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0280  transposase IS4 family protein  37.31 
 
 		 268 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0282  transposase IS4 family protein  37.31 
 
 		 268 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.823794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1472  transposase IS4 family protein  37.31 
 
 		 268 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  hitchhiker  0.0000000061628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0839  transposase IS4 family protein  37.31 
 
 		 268 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4213  transposase, IS4  39.39 
 
 		 174 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4189  transposase IS4 family protein  37.31 
 
 		 268 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0203984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4006  transposase, IS4  37.98 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>