247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1953 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1953  putative transposase A-like protein  100 
 
 
391 aa  771    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.520795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2249  putative transposase A-like protein  82.6 
 
 
401 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.909446  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1055  putative transposase A-like protein  52.82 
 
 
438 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.733462  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0271  hypothetical protein  47.03 
 
 
334 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.852206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0303  hypothetical protein  47.03 
 
 
334 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2626  transposase  49.55 
 
 
334 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1451  hypothetical protein  47.03 
 
 
334 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1648  hypothetical protein  47.03 
 
 
334 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0920  hypothetical protein  49.55 
 
 
373 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2488  hypothetical protein  49.55 
 
 
334 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0541  hypothetical protein  50.48 
 
 
390 aa  255  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5544  hypothetical protein  50.99 
 
 
313 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152908  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3721  hypothetical protein  50.84 
 
 
314 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.313369  normal  0.0880548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3706  hypothetical protein  50.17 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4545  hypothetical protein  50.17 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3818  hypothetical protein  50.17 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.546084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4921  hypothetical protein  48.85 
 
 
310 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0271882 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7183  putative transposase A-like protein  42.57 
 
 
283 aa  212  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173089  normal  0.690368 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6232  putative transposase A-like protein  42.76 
 
 
290 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.489662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2278  hypothetical protein  41.97 
 
 
313 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1069  hypothetical protein  55.15 
 
 
132 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0985  hypothetical protein  55.15 
 
 
132 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1756  hypothetical protein  55.15 
 
 
132 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1909  hypothetical protein  55.15 
 
 
132 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.555093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0181  hypothetical protein  55.15 
 
 
132 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000811321  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2570  ISBm1, transposase orfA, interruption-N  55.15 
 
 
132 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1734  hypothetical protein  55.15 
 
 
132 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1513  hypothetical protein  55.15 
 
 
132 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1625  putative transposase A protein  55.15 
 
 
133 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2827  putative transposase A protein  55.15 
 
 
132 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897465  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1736  putative transposase A protein  55.15 
 
 
132 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0757752  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1415  hypothetical protein  54.41 
 
 
133 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.631309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1762  hypothetical protein  54.41 
 
 
133 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695632  normal  0.0625583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1469  hypothetical protein  54.41 
 
 
133 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.270424  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4634  hypothetical protein  54.41 
 
 
133 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578945  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1012  hypothetical protein  54.41 
 
 
133 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1375  hypothetical protein  54.41 
 
 
133 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1493  hypothetical protein  54.41 
 
 
133 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1482  hypothetical protein  48.92 
 
 
210 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1347  putative transposase  48.92 
 
 
229 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1340  putative transposase  48.92 
 
 
229 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2884  hypothetical protein  48.89 
 
 
223 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4653  hypothetical protein  43.53 
 
 
136 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385837  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1032  hypothetical protein  43.53 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1512  hypothetical protein  43.53 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1488  hypothetical protein  43.53 
 
 
136 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187879  hitchhiker  0.000281103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1394  hypothetical protein  42.86 
 
 
136 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.997905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1434  hypothetical protein  41.67 
 
 
136 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00387753  normal  0.0246951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1743  hypothetical protein  43.53 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  41.46 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  39.29 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  37.63 
 
 
150 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1047  hypothetical protein  40.26 
 
 
136 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1755  hypothetical protein  40.26 
 
 
136 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1777  hypothetical protein  40.26 
 
 
136 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1004  hypothetical protein  40.26 
 
 
136 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0627317  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1928  hypothetical protein  40.26 
 
 
136 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.643232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0162  hypothetical protein  40.26 
 
 
136 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1494  hypothetical protein  40.26 
 
 
136 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2552  hypothetical protein  40.26 
 
 
136 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5541  putative insertion element transposase  37.65 
 
 
87 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73359  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  40.24 
 
 
254 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  40.24 
 
 
254 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  40.24 
 
 
254 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  40.24 
 
 
254 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  40.24 
 
 
254 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  41.33 
 
 
122 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  41.33 
 
 
122 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  36.14 
 
 
123 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  36.14 
 
 
123 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  36.14 
 
 
123 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  36.14 
 
 
123 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  36.14 
 
 
123 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  38.67 
 
 
122 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  38.67 
 
 
244 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 
252 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6488  transposase  36.49 
 
 
103 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  38.1 
 
 
149 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  33.33 
 
 
123 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  33.33 
 
 
123 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  33.33 
 
 
123 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  36.49 
 
 
132 aa  57  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  36.49 
 
 
132 aa  57  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  35.9 
 
 
143 aa  56.6  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  34.52 
 
 
254 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  34.52 
 
 
254 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  34.52 
 
 
254 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  34.52 
 
 
254 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  34.52 
 
 
254 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  34.52 
 
 
254 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  40.74 
 
 
134 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  40.74 
 
 
134 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  40.74 
 
 
134 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  40.74 
 
 
134 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  40.74 
 
 
134 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  40.74 
 
 
134 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  32.93 
 
 
126 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  34.12 
 
 
142 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  36.59 
 
 
142 aa  55.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6770  putative transposase  34.12 
 
 
117 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0648258  normal  0.255889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>