More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3789 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  100 
 
 
136 aa  275  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  100 
 
 
136 aa  275  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  100 
 
 
136 aa  275  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  91.18 
 
 
141 aa  250  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  91.18 
 
 
141 aa  250  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  91.18 
 
 
141 aa  250  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  91.18 
 
 
141 aa  250  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  91.18 
 
 
141 aa  250  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  91.18 
 
 
141 aa  250  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  91.18 
 
 
141 aa  250  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  91.18 
 
 
141 aa  250  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  84.44 
 
 
141 aa  231  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  69.23 
 
 
139 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  69.17 
 
 
134 aa  175  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  69.17 
 
 
134 aa  175  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  69.17 
 
 
134 aa  175  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  69.17 
 
 
134 aa  175  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  69.17 
 
 
134 aa  175  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  69.17 
 
 
134 aa  175  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1905  hypothetical protein  97.14 
 
 
101 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.519601  normal  0.0126104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  50 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  46.03 
 
 
147 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  51.3 
 
 
268 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  47.9 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  46.22 
 
 
274 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  50.89 
 
 
276 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1733  putative TIS1421-transposase orfA protein  82.81 
 
 
64 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  50.89 
 
 
276 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  42.62 
 
 
258 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  54.88 
 
 
268 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  54.88 
 
 
268 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  48.91 
 
 
268 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  51.76 
 
 
267 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  42.62 
 
 
268 aa  90.5  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  45.45 
 
 
268 aa  87.8  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  50.57 
 
 
268 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2278  hypothetical protein  47.13 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1743  transposase  37.07 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331914  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3633  transposase  37.07 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0497794 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05986  hypothetical protein  31.4 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02894  hypothetical protein  31.4 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02157  hypothetical protein  31.4 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02821  hypothetical protein  31.4 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05842  hypothetical protein  31.4 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05085  hypothetical protein  31.4 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05896  hypothetical protein  31.4 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06086  hypothetical protein  31.86 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  28.91 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05998  hypothetical protein  30.58 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.26 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  32.37 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04735  hypothetical protein  30.7 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2176  transposase and inactivated derivatives-like protein  37.14 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.55 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4945  transposase  32.61 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4964  transposase  32.61 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0783623 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.64 
 
 
281 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.73 
 
 
281 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  31.5 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0667  hypothetical protein  29.57 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01097  hypothetical protein  31 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  36.36 
 
 
260 aa  58.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2681  hypothetical protein  28.45 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0215998  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  37.5 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  37.5 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  37.5 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  37.5 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  37.5 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3887  transposase and inactivated derivatives-like  33.88 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1516  transposase  35.65 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000901258  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  35.45 
 
 
260 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3270  transposase and inactivated derivatives-like protein  32.73 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4780  transposase and inactivated derivatives-like protein  32.73 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3937  transposase and inactivated derivatives-like protein  32.73 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  35.45 
 
 
260 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  35.45 
 
 
260 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4622  transposase and inactivated derivatives-like protein  32.73 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0775  transposase and inactivated derivatives-like protein  32.73 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1329  hypothetical protein  31.3 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  38.64 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  38.64 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  38.64 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  38.64 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  38.64 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  38.64 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  38.64 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  38.64 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  38.64 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  38.64 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  38.64 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.63 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  38.64 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  38.64 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1739  hypothetical protein  31.3 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  29.55 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  31.4 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  37.21 
 
 
271 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.36 
 
 
252 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  34.4 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  34.4 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>