More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0172 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  100 
 
 		 147 aa  293  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  85.59 
 
 		 258 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  54.42 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.79 
 
 		 136 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.79 
 
 		 136 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.79 
 
 		 136 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.33 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.33 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.33 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.33 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.33 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.33 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.33 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.33 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  48.46 
 
 		 274 aa  120  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  52.59 
 
 		 268 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  46.04 
 
 		 277 aa  114  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  54.24 
 
 		 268 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  45.8 
 
 		 139 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  46.77 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  46.77 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  46.77 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  46.77 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  46.77 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  46.77 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  50.76 
 
 		 267 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  49.21 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  49.21 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  43.7 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  53.39 
 
 		 268 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  53.39 
 
 		 268 aa  110  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  58.02 
 
 		 268 aa  100  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  58.02 
 
 		 268 aa  100  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2176  transposase and inactivated derivatives-like protein  44.55 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  45.87 
 
 		 268 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1905  hypothetical protein  53.85 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.519601  normal  0.0126104 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1059  hypothetical protein  34.92 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05842  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05085  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02894  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02821  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02157  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05896  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05986  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4945  transposase  33.33 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4964  transposase  33.33 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0783623 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06086  hypothetical protein  37.61 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05998  hypothetical protein  37.69 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  37.58 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  37.58 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0870  transposase  38.3 
 
 		 175 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  38.66 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.88 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  38.66 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  38.66 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  38.66 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  38.66 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04735  hypothetical protein  37.61 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  36.91 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  36.91 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  36.89 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  36.89 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  36.89 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01097  hypothetical protein  42.68 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1733  putative TIS1421-transposase orfA protein  56 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2278  hypothetical protein  46.38 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  38.33 
 
 		 295 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  38.33 
 
 		 295 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  38.33 
 
 		 295 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  29.73 
 
 		 272 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  40.57 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  33.58 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  33.58 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  40.57 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  33.58 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3887  transposase and inactivated derivatives-like  31.62 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  35.34 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  35.34 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3439  IS1647-like transposase  33.03 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  35.34 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  37.61 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2681  hypothetical protein  29.73 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0215998  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  33.55 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  39.77 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  37.61 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  37.61 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  37.61 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  37.61 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  34.85 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  34.85 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  37.78 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  38.64 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  32.76 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  35.77 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  32.76 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 		 252 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 		 252 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  31.03 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  31.03 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  31.03 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>