43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2176 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2176  transposase and inactivated derivatives-like protein  100 
 
 		 114 aa  228  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  75.81 
 
 		 268 aa  100  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  75.41 
 
 		 267 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  77.42 
 
 		 268 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  75.81 
 
 		 268 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  44.09 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  47.06 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  47.06 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  50 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  38.1 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  38.1 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  38.1 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  38.1 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  38.1 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  38.1 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  38.1 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  38.1 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  45.07 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  37.14 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  37.14 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  37.14 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  45.33 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  39.53 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  48.44 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  39.18 
 
 		 258 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  48.44 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  39.33 
 
 		 268 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  45.16 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  46.77 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1059  hypothetical protein  37.21 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  46.67 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  46.67 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  46.67 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  46.67 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  46.67 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  46.67 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2278  hypothetical protein  39.34 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1905  hypothetical protein  38.71 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.519601  normal  0.0126104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4762  transposase, IS4 family protein  47.27 
 
 		 58 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6624  TIS1421-transposase protein A  33.93 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.29117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  35.29 
 
 		 283 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  35.29 
 
 		 283 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  35.29 
 
 		 291 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>