More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05842 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05986  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  271  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02157  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  271  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02894  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  271  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05842  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  271  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05085  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  271  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05896  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  271  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02821  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  271  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05998  hypothetical protein  99.22 
 
 
128 aa  268  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04735  hypothetical protein  99.14 
 
 
116 aa  246  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06086  hypothetical protein  95.73 
 
 
117 aa  241  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01097  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  219  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3633  transposase  55.08 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0497794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1743  transposase  55.08 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331914  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  46.9 
 
 
272 aa  101  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4945  transposase  37.12 
 
 
163 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4964  transposase  37.12 
 
 
163 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0783623 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0870  transposase  38.46 
 
 
175 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  34.13 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  34.13 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  34.13 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  34.13 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  34.13 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  34.13 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  34.13 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  34.13 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  38.33 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  37.39 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  37.39 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  37.39 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  37.39 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  37.39 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  37.39 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3240  transposase  37.04 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  35.94 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  36.84 
 
 
274 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  38.4 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  36.09 
 
 
277 aa  70.1  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  31.4 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  31.4 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  31.4 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.54 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5284  hypothetical protein  36.19 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.550113  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  37.5 
 
 
268 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  34.65 
 
 
276 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  34.65 
 
 
276 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  41.86 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  41.86 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  41.86 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2681  hypothetical protein  33.03 
 
 
119 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0215998  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  37.97 
 
 
268 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  37.97 
 
 
268 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  33.86 
 
 
258 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  36 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  40.48 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  36 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3088  hypothetical protein  33.03 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0452769  normal  0.0619114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  32.08 
 
 
280 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0667  hypothetical protein  31.45 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.58 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  29.51 
 
 
291 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  37.65 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  37.65 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  44.05 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  44.05 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  44.05 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3439  IS1647-like transposase  34.58 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  44.05 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  44.05 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  44.05 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  44.05 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  44.05 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  44.05 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  44.05 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  44.05 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  44.05 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  44.05 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  44.05 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  28.69 
 
 
283 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  28.69 
 
 
283 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  30.71 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  35.63 
 
 
254 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  35.63 
 
 
254 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  35.63 
 
 
254 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  35.63 
 
 
254 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.84 
 
 
251 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  35.63 
 
 
254 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1739  hypothetical protein  32.11 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1329  hypothetical protein  32.11 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  34.12 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1708  transposase IS4 family protein  34.62 
 
 
273 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4649  IS5 family transposase OrfA  29.75 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  37.18 
 
 
278 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.55 
 
 
252 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  37.04 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  38.1 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0073  transposase  33.33 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0080  transposase  33.33 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0169  transposase  32.05 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103763  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  36.47 
 
 
254 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  37.04 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>