198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3633 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1743  transposase  100 
 
 		 163 aa  333  7e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331914  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3633  transposase  100 
 
 		 163 aa  333  7e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0497794 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06086  hypothetical protein  58.62 
 
 		 117 aa  144  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05085  hypothetical protein  55.08 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05842  hypothetical protein  55.08 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05986  hypothetical protein  55.08 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05896  hypothetical protein  55.08 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02894  hypothetical protein  55.08 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02821  hypothetical protein  55.08 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02157  hypothetical protein  55.08 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05998  hypothetical protein  53.78 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04735  hypothetical protein  57.02 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01097  hypothetical protein  55.45 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4945  transposase  36.81 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4964  transposase  36.81 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0783623 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  39.17 
 
 		 272 aa  97.1  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0870  transposase  32.74 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  39.25 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  35.83 
 
 		 283 aa  78.2  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  35.83 
 
 		 291 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  35.83 
 
 		 283 aa  78.2  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  41.03 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  38.05 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  38.05 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  38.05 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  38.05 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  38.05 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  38.05 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3240  transposase  32.54 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  37.07 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  37.07 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  37.07 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  37.39 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  37.39 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  37.39 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  37.39 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  37.39 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  37.39 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  37.39 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  37.39 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  38.66 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  36.59 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  38.14 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  38.14 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  35.59 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  37.82 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  35.65 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  34.68 
 
 		 258 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  38.66 
 
 		 268 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  33.33 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5284  hypothetical protein  36.63 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.550113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  33.88 
 
 		 274 aa  60.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  38.66 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  39.32 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  32.46 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.64 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  34.19 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.13 
 
 		 281 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.84 
 
 		 281 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.13 
 
 		 281 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.13 
 
 		 281 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  35.9 
 
 		 268 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  35.9 
 
 		 268 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  37.11 
 
 		 123 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  37.11 
 
 		 123 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  37.11 
 
 		 123 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  37.11 
 
 		 123 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  37.11 
 
 		 123 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  30.63 
 
 		 121 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  30.63 
 
 		 121 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  30.63 
 
 		 121 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1102  putative transposase  28.44 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.334321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  33.33 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0073  transposase  39.74 
 
 		 127 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0080  transposase  37.18 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0800  transposase  37.18 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1018  transposase  37.18 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1364  transposase  37.18 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906746  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2641  transposase  37.18 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3317  transposase  37.18 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000684443  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3800  transposase  37.18 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  32.88 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  33.33 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1059  hypothetical protein  27.08 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2552  hypothetical protein  32 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  28.57 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1047  hypothetical protein  32 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128827  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2752  transposase  35.06 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0725  transposase  33.77 
 
 		 127 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.569025  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3838  transposase  35.06 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2123  transposase  35.06 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00183636  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0169  transposase  35.9 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103763  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1928  hypothetical protein  32 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.643232  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2849  transposase  35.06 
 
 		 127 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1494  hypothetical protein  32 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0162  hypothetical protein  32 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1755  hypothetical protein  32 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1777  hypothetical protein  32 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1004  hypothetical protein  32 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0627317  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2319  transposase  35.06 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>