More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3790 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
170 aa  343  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
170 aa  343  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
170 aa  343  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  94.12 
 
 
173 aa  327  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  94.55 
 
 
173 aa  317  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1734  transposase, IS4 family protein  78.4 
 
 
140 aa  207  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  61.04 
 
 
268 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3722  transposase, IS4 family protein  82.14 
 
 
112 aa  193  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0136631  hitchhiker  0.000781159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2524  transposase, IS4 family protein  82.14 
 
 
112 aa  193  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824327  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3094  transposase, IS4 family protein  82.14 
 
 
112 aa  193  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0335819  normal  0.853001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4477  transposase, IS4 family protein  82.14 
 
 
112 aa  193  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.164245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3622  transposase, IS4 family protein  82.14 
 
 
112 aa  193  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968819  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2047  transposase, IS4 family protein  82.14 
 
 
112 aa  193  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3631  transposase, IS4 family protein  82.14 
 
 
112 aa  193  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411326  normal  0.17845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1726  transposase, IS4 family protein  82.14 
 
 
112 aa  193  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  68.75 
 
 
128 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  68.75 
 
 
128 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  68.75 
 
 
128 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  68.75 
 
 
128 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  68.75 
 
 
128 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  68.75 
 
 
128 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  59.21 
 
 
274 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  54.49 
 
 
268 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  54.49 
 
 
268 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  54.25 
 
 
277 aa  155  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  58.71 
 
 
268 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  52.83 
 
 
247 aa  154  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  55.77 
 
 
276 aa  154  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  55.77 
 
 
276 aa  154  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  47.44 
 
 
209 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  47.44 
 
 
209 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  47.44 
 
 
209 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  47.44 
 
 
209 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  47.44 
 
 
209 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  47.44 
 
 
209 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  47.44 
 
 
209 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  49.38 
 
 
262 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  49.38 
 
 
262 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  49.38 
 
 
262 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  52.56 
 
 
204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  56.46 
 
 
296 aa  140  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  53.02 
 
 
268 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  52.35 
 
 
268 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  45.14 
 
 
258 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  54.42 
 
 
216 aa  134  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  48.91 
 
 
144 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  52.03 
 
 
267 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  52.03 
 
 
268 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  52.07 
 
 
136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  41.94 
 
 
272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  38.22 
 
 
280 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  38.71 
 
 
291 aa  101  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  39.1 
 
 
283 aa  100  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  39.1 
 
 
283 aa  100  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0173  transposase, IS4 family protein  36.84 
 
 
123 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3504  transposase, IS4 family protein  40.32 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249811  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4722  IS4 family transposase  39.73 
 
 
232 aa  81.3  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0555  ISJP4 transposase  32.93 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0733483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2623  hypothetical protein  43.2 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06084  hypothetical protein  32.06 
 
 
132 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01099  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02156  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02820  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05895  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05841  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05987  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02895  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05084  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  38.04 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  38.04 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  38.04 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1877  transposase, IS4  54.55 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  32.45 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  31.47 
 
 
140 aa  61.2  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  31.47 
 
 
140 aa  61.2  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.5 
 
 
281 aa  58.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  28.78 
 
 
146 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  27.63 
 
 
294 aa  58.2  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.5 
 
 
281 aa  57.8  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.58 
 
 
281 aa  57.4  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  30.91 
 
 
304 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.58 
 
 
281 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  28.57 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  28.57 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  28.57 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  33.94 
 
 
265 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  32.1 
 
 
270 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  32.65 
 
 
274 aa  54.7  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2877  hypothetical protein  41.46 
 
 
129 aa  54.7  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.500352  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  32.65 
 
 
274 aa  54.7  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4117  transposase, IS4  33.33 
 
 
145 aa  54.7  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2513  putative transposase  40.23 
 
 
128 aa  54.7  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  32.65 
 
 
274 aa  54.7  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  32.65 
 
 
274 aa  54.7  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  32.65 
 
 
274 aa  54.7  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  32.65 
 
 
274 aa  54.3  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  29.5 
 
 
145 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  29.5 
 
 
145 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  32.65 
 
 
274 aa  54.7  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  32.65 
 
 
274 aa  54.7  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>