More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1908 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
173 aa  347  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  99.39 
 
 
173 aa  330  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  94.12 
 
 
170 aa  327  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  94.12 
 
 
170 aa  327  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  94.12 
 
 
170 aa  327  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1734  transposase, IS4 family protein  76.8 
 
 
140 aa  203  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  60.39 
 
 
268 aa  189  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1726  transposase, IS4 family protein  80.36 
 
 
112 aa  188  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2524  transposase, IS4 family protein  80.36 
 
 
112 aa  188  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824327  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2047  transposase, IS4 family protein  80.36 
 
 
112 aa  188  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3631  transposase, IS4 family protein  80.36 
 
 
112 aa  188  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411326  normal  0.17845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3094  transposase, IS4 family protein  80.36 
 
 
112 aa  188  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0335819  normal  0.853001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3622  transposase, IS4 family protein  80.36 
 
 
112 aa  188  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968819  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4477  transposase, IS4 family protein  80.36 
 
 
112 aa  188  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.164245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3722  transposase, IS4 family protein  80.36 
 
 
112 aa  188  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0136631  hitchhiker  0.000781159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  66.41 
 
 
128 aa  187  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  66.41 
 
 
128 aa  187  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  66.41 
 
 
128 aa  187  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  66.41 
 
 
128 aa  187  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  66.41 
 
 
128 aa  187  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  66.41 
 
 
128 aa  187  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  57.89 
 
 
274 aa  158  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  53.21 
 
 
268 aa  157  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  53.21 
 
 
268 aa  157  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  54.25 
 
 
277 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  54.49 
 
 
276 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  54.49 
 
 
276 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  46.79 
 
 
209 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  46.79 
 
 
209 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  46.79 
 
 
209 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  46.79 
 
 
209 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  46.79 
 
 
209 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  46.79 
 
 
209 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  46.79 
 
 
209 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  50.31 
 
 
247 aa  147  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  54.84 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  47.93 
 
 
262 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  47.93 
 
 
262 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  47.93 
 
 
262 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  53.37 
 
 
296 aa  140  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  49.69 
 
 
204 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  55.1 
 
 
216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  51.68 
 
 
268 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  47.45 
 
 
144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  52.35 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  51.35 
 
 
268 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  51.35 
 
 
267 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  44.44 
 
 
258 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  42.77 
 
 
272 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  39.49 
 
 
280 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  51.24 
 
 
136 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  38.85 
 
 
291 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  38.85 
 
 
283 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  38.85 
 
 
283 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0173  transposase, IS4 family protein  36.84 
 
 
123 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4722  IS4 family transposase  39.31 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2623  hypothetical protein  42.4 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0555  ISJP4 transposase  33.53 
 
 
212 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0733483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3504  transposase, IS4 family protein  38.71 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249811  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05987  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02820  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05895  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01099  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02895  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05841  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02156  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05084  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1877  transposase, IS4  56.06 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06084  hypothetical protein  30.53 
 
 
132 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  30.07 
 
 
303 aa  64.3  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  30.07 
 
 
303 aa  64.3  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  30.07 
 
 
303 aa  64.3  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  31.72 
 
 
140 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  31.72 
 
 
140 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  32.45 
 
 
158 aa  61.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  28.06 
 
 
146 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.17 
 
 
281 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.28 
 
 
281 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 
281 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  27.63 
 
 
294 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.28 
 
 
281 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  30.91 
 
 
304 aa  54.7  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2877  hypothetical protein  41.46 
 
 
129 aa  54.3  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.500352  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4117  transposase, IS4  34.03 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  29.5 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  29.5 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  27.39 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  32.86 
 
 
274 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2179  transposase IS4 family protein  26.53 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.488583  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  28.06 
 
 
145 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  32.86 
 
 
274 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  32.86 
 
 
274 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  27.39 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  31.48 
 
 
270 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  32.1 
 
 
265 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  32.86 
 
 
274 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  32.86 
 
 
274 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  32.86 
 
 
274 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  32.86 
 
 
274 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  27.39 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>