68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2623 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2623  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  355  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  70.73 
 
 		 274 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  65.87 
 
 		 277 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  70.73 
 
 		 276 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  70.73 
 
 		 276 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  48.78 
 
 		 170 aa  111  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  48.78 
 
 		 170 aa  111  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  48.78 
 
 		 170 aa  111  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  47.97 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  47.97 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  45.16 
 
 		 268 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  46.94 
 
 		 128 aa  87  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  46.94 
 
 		 128 aa  87  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  46.94 
 
 		 128 aa  87  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  46.94 
 
 		 128 aa  87  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  46.94 
 
 		 128 aa  87  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  46.94 
 
 		 128 aa  87  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1734  transposase, IS4 family protein  50.53 
 
 		 140 aa  85.1  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  39.82 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  37.82 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  41.94 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  36.13 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  36.13 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  36.13 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  40.74 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  39.43 
 
 		 268 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  39.43 
 
 		 268 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  47.97 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3622  transposase, IS4 family protein  55.26 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968819  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4477  transposase, IS4 family protein  55.26 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.164245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3722  transposase, IS4 family protein  55.26 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0136631  hitchhiker  0.000781159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3631  transposase, IS4 family protein  55.26 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411326  normal  0.17845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3094  transposase, IS4 family protein  55.26 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0335819  normal  0.853001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2047  transposase, IS4 family protein  55.26 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  39.81 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  39.81 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  39.81 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2524  transposase, IS4 family protein  55.26 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  39.81 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  39.81 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  39.81 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  39.81 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1726  transposase, IS4 family protein  55.26 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  37.93 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  45.16 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  43.33 
 
 		 268 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  43.33 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  42.5 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  42.5 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0173  transposase, IS4 family protein  35.11 
 
 		 123 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  31.36 
 
 		 140 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  31.36 
 
 		 140 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  29.23 
 
 		 272 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  36 
 
 		 303 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  36 
 
 		 303 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  36 
 
 		 303 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  33.75 
 
 		 294 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  29.7 
 
 		 280 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0555  ISJP4 transposase  33.01 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0733483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  30.1 
 
 		 291 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  30.1 
 
 		 283 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  30.1 
 
 		 283 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1877  transposase, IS4  40 
 
 		 160 aa  42.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  34.67 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  29.31 
 
 		 171 aa  41.2  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  29.31 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  29.31 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>