89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1877 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1877  transposase, IS4  100 
 
 		 160 aa  317  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  68.98 
 
 		 216 aa  248  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  67.59 
 
 		 296 aa  238  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  50.57 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2024  putative transposase  80 
 
 		 70 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  35.52 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  36.31 
 
 		 268 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  53.73 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  53.73 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  53.73 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  53.73 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  53.73 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  53.73 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  58.21 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  61.02 
 
 		 268 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  54.79 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  48.42 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  48.42 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  48.42 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  50 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  50 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  53.52 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  53.52 
 
 		 267 aa  71.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  51.32 
 
 		 268 aa  70.9  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  51.32 
 
 		 268 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4477  transposase, IS4 family protein  52.05 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.164245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3722  transposase, IS4 family protein  52.05 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0136631  hitchhiker  0.000781159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3631  transposase, IS4 family protein  52.05 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411326  normal  0.17845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3622  transposase, IS4 family protein  52.05 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968819  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3094  transposase, IS4 family protein  52.05 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0335819  normal  0.853001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2524  transposase, IS4 family protein  52.05 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2047  transposase, IS4 family protein  52.05 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1726  transposase, IS4 family protein  52.05 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  39.05 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  50.77 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  39.05 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  39.05 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  39.05 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  39.05 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  39.05 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  39.05 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  51.56 
 
 		 276 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  51.56 
 
 		 276 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0173  transposase, IS4 family protein  44 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1734  transposase, IS4 family protein  49.25 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  37.76 
 
 		 258 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7817  transposase  41.67 
 
 		 92 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  29.84 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  49.28 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 		 247 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  45.95 
 
 		 204 aa  47.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  42.31 
 
 		 262 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  42.31 
 
 		 262 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  42.31 
 
 		 262 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06084  hypothetical protein  37.04 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01099  hypothetical protein  37.04 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05987  hypothetical protein  37.04 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05895  hypothetical protein  37.04 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02156  hypothetical protein  37.04 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02820  hypothetical protein  37.04 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05841  hypothetical protein  37.04 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04737  hypothetical protein  37.04 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.79 
 
 		 252 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.79 
 
 		 252 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2179  transposase IS4 family protein  37.5 
 
 		 181 aa  44.7  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05084  hypothetical protein  35.19 
 
 		 133 aa  44.3  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02895  hypothetical protein  35.19 
 
 		 133 aa  44.3  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06072  hypothetical protein  45.45 
 
 		 57 aa  43.9  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2623  hypothetical protein  60.53 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  35.42 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  34.25 
 
 		 283 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  34.25 
 
 		 283 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  33.78 
 
 		 291 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  35.42 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  35.19 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  35.19 
 
 		 252 aa  41.6  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  43.75 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  33.8 
 
 		 272 aa  41.6  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  35.19 
 
 		 252 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  43.94 
 
 		 278 aa  40.8  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  28.7 
 
 		 116 aa  40.8  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  42.86 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  42.86 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  31.48 
 
 		 112 aa  40.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  42.86 
 
 		 176 aa  40.4  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  42.86 
 
 		 176 aa  40.4  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  31.48 
 
 		 112 aa  40.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  31.48 
 
 		 112 aa  40.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  31.48 
 
 		 112 aa  40.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>