74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0555 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0555  ISJP4 transposase  100 
 
 
212 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0733483  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  55.56 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  56.41 
 
 
204 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  53.85 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  53.85 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  53.85 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  61.29 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  44.35 
 
 
209 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  44.35 
 
 
209 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  44.35 
 
 
209 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  44.35 
 
 
209 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  44.35 
 
 
209 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  44.35 
 
 
209 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  44.35 
 
 
209 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  48.25 
 
 
268 aa  97.8  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  48.25 
 
 
268 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  41.13 
 
 
258 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  45.45 
 
 
268 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  54.37 
 
 
267 aa  92.8  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0173  transposase, IS4 family protein  48.42 
 
 
123 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  32.93 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  32.93 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  32.93 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  41.58 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  41.58 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  41.58 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  41.58 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  41.58 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  41.58 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  33.53 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  33.53 
 
 
173 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  41.9 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  41.22 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  41.22 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1734  transposase, IS4 family protein  37.01 
 
 
140 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3162  hypothetical protein  42.73 
 
 
118 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290127  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3504  transposase, IS4 family protein  31.85 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249811  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  33.04 
 
 
144 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  34.59 
 
 
280 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1726  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 
112 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4477  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 
112 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.164245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3722  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 
112 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0136631  hitchhiker  0.000781159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3631  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 
112 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411326  normal  0.17845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3622  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 
112 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968819  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3094  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 
112 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0335819  normal  0.853001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2524  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 
112 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824327  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2047  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 
112 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  32.8 
 
 
274 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  37.8 
 
 
303 aa  52.4  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  37.8 
 
 
303 aa  52.4  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  37.8 
 
 
303 aa  52.4  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  34.88 
 
 
268 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  31.33 
 
 
146 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06084  hypothetical protein  32.71 
 
 
132 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  34.68 
 
 
296 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02156  hypothetical protein  31.78 
 
 
133 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05987  hypothetical protein  31.78 
 
 
133 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05895  hypothetical protein  31.78 
 
 
133 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05841  hypothetical protein  31.78 
 
 
133 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05084  hypothetical protein  31.78 
 
 
133 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02895  hypothetical protein  31.78 
 
 
133 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02820  hypothetical protein  31.78 
 
 
133 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01099  hypothetical protein  31.78 
 
 
133 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4362  hypothetical protein  62.5 
 
 
76 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  29.69 
 
 
277 aa  45.1  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  30.38 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  29.6 
 
 
276 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  29.6 
 
 
276 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  33.87 
 
 
216 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  40.74 
 
 
294 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  32.91 
 
 
145 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  32.91 
 
 
145 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  26.96 
 
 
272 aa  41.6  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1887  hypothetical protein  55.88 
 
 
163 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000134466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>