More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1740 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
140 aa  290  4e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
140 aa  290  4e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2179  transposase IS4 family protein  54.17 
 
 
181 aa  156  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.488583  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2682  putative transposase  58.43 
 
 
90 aa  94  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00783753  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1302  hypothetical protein  58.43 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.534193 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3089  putative transposase  58.43 
 
 
90 aa  93.6  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0561407  normal  0.0601235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0690  IS1648 transposase  51.58 
 
 
95 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.194342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  35.25 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  34.06 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  34.06 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  32.85 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  32.37 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  32.37 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  32.31 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  32.31 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  32.31 
 
 
210 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  32.61 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  31.21 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  29.77 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  29.77 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2822  transposase, IS4  30.95 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  29.77 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  30.61 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  29.86 
 
 
303 aa  70.5  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  29.86 
 
 
303 aa  70.5  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  29.86 
 
 
303 aa  70.5  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.65 
 
 
252 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  37.37 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0204  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0519  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1037  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0972527  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0914  IS711, transposase orfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1381  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.879769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0531  IS711, transposase orfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0327  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0345  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.932854  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1154  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1234  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.177063  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1932  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1142  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319477  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0725  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0158  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00557351  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0781  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0721  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0419  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0130  IS711, transposase orfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00263844  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0470  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0838  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.578121  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  30.53 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.71 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.71 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  30.53 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11059  transposase  38.54 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  38.54 
 
 
287 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0135  IS711, transposase orfB  31.39 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0527  IS711, transposase orfB  31.39 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15582  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1673  IS711, transposase orfB  31.39 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0847  IS711, transposase orfB  31.39 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.791193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  30.5 
 
 
272 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1764  transposase OrfB  32.12 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246396  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  32.59 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  32.59 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  32.59 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  32.59 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  32.59 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  32.59 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  32.87 
 
 
216 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  30.34 
 
 
277 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  31.72 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  32.87 
 
 
296 aa  62  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  31.94 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  29.84 
 
 
259 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7001  transposase IS4 family protein  29.63 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  31.47 
 
 
170 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2685  transposase, IS4  35.71 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  31.47 
 
 
170 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  31.47 
 
 
170 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  29.55 
 
 
260 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.29 
 
 
281 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  29.55 
 
 
260 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  29.55 
 
 
260 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  29.55 
 
 
260 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  31.58 
 
 
251 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  31.58 
 
 
251 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.87 
 
 
251 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  31.21 
 
 
268 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03129  ISXoo11 transposase  31.67 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  31.62 
 
 
294 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  30.43 
 
 
209 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  30.43 
 
 
209 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  30.43 
 
 
209 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  30.43 
 
 
209 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  30.43 
 
 
209 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  30.43 
 
 
209 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  30.43 
 
 
209 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  29.37 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  31.21 
 
 
268 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  36.67 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  32.39 
 
 
274 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4722  IS4 family transposase  29.93 
 
 
232 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>