More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2179 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2179  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 181 aa  362  2e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  54.17 
 
 		 140 aa  156  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  54.17 
 
 		 140 aa  156  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  36.24 
 
 		 177 aa  89.4  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  34.25 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1302  hypothetical protein  50.56 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.534193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  30.41 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  29.45 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  30.41 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  30.41 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2682  putative transposase  50.56 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00783753  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  28.77 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  28.77 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  31.62 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  34.69 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3089  putative transposase  50.56 
 
 		 90 aa  72  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0561407  normal  0.0601235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  32.59 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  32.59 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4009  transposase, IS4  31.5 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  33.96 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  33.96 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  31.85 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  40 
 
 		 136 aa  67  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0690  IS1648 transposase  43.16 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.194342 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  28.57 
 
 		 260 aa  64.3  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20960  putative Transposase, IS4 family  32.46 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  33.33 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  32.95 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  32.95 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  32.95 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  32.95 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  29.86 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  30.34 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  29.66 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  30.56 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14750  putative Transposase, IS4 family  32.37 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.337332  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21800  putative Transposase, IS4 family  32.37 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.06 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14930  putative Transposase, IS4 family  31.65 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14820  putative Transposase, IS4 family  31.65 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0399604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23120  putative Transposase, IS4 family  31.65 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15000  putative Transposase, IS4 family  31.65 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.09593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06560  putative Transposase, IS4 family  31.65 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180916  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  29.17 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  29.17 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  29.17 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  29.17 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  29.17 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  29.17 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  29.17 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.31 
 
 		 281 aa  57.8  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.31 
 
 		 281 aa  57.8  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  26.71 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  24.14 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  31.37 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2685  transposase, IS4  32.58 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.45 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  28.95 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  27.34 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0751  ISPs1, transposase OrfB  44.64 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  34.07 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11059  transposase  33.67 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  34.04 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  34.74 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4697  ISPs1, transposase OrfB  31.91 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  35.16 
 
 		 95 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  34.41 
 
 		 251 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  23.97 
 
 		 250 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  23.97 
 
 		 250 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.11 
 
 		 281 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  34.41 
 
 		 251 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  26.53 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  31.1 
 
 		 296 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  26.53 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  26.53 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  31.29 
 
 		 268 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  34.26 
 
 		 102 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  27.78 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  27.78 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  27.78 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  27.78 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  27.78 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  25.87 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  26.21 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  26.21 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  32.63 
 
 		 253 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  32.63 
 
 		 253 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  26.53 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  32.63 
 
 		 253 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  31.87 
 
 		 253 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  26.71 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06540  putative Transposase IS4  33.33 
 
 		 124 aa  52  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231609  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  26.62 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  34.41 
 
 		 86 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  26.21 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  28.24 
 
 		 251 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  30.63 
 
 		 176 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.11 
 
 		 281 aa  51.6  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>