214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05084 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02895  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  275  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05084  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  275  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05987  hypothetical protein  99.25 
 
 		 133 aa  274  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05895  hypothetical protein  99.25 
 
 		 133 aa  274  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01099  hypothetical protein  99.25 
 
 		 133 aa  274  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02156  hypothetical protein  99.25 
 
 		 133 aa  274  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02820  hypothetical protein  99.25 
 
 		 133 aa  274  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05841  hypothetical protein  99.25 
 
 		 133 aa  274  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06084  hypothetical protein  96.21 
 
 		 132 aa  266  8.999999999999999e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04737  hypothetical protein  96.63 
 
 		 98 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  51.13 
 
 		 272 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06072  hypothetical protein  96.49 
 
 		 57 aa  120  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04736  hypothetical protein  85.96 
 
 		 58 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4722  IS4 family transposase  38.85 
 
 		 232 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05999  hypothetical protein  100 
 
 		 48 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3634  transposase  50.65 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0427337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1745  transposase  50.65 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  35.25 
 
 		 268 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  35.25 
 
 		 268 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  34.33 
 
 		 268 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  35.82 
 
 		 247 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  37.31 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  35.07 
 
 		 262 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  35.07 
 
 		 262 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  35.07 
 
 		 262 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  32.35 
 
 		 209 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  32.35 
 
 		 209 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  32.35 
 
 		 209 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  32.35 
 
 		 209 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  32.35 
 
 		 209 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  32.35 
 
 		 209 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  32.35 
 
 		 209 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  33.08 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  31.06 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  31.06 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  31.06 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  31.06 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  31.06 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  32 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  32 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  32 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  32 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  32 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  32 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  27.41 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  27.41 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  28.15 
 
 		 268 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  27.41 
 
 		 267 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  35.94 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  30.6 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  30.16 
 
 		 280 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  32.86 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  32.35 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3504  transposase, IS4 family protein  28.79 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  32.35 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  32.35 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  29.69 
 
 		 258 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  30.22 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  30.22 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  29.13 
 
 		 291 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  31.4 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  29.93 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  29.13 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  30.22 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  29.13 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  30.23 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  30.23 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  30.23 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  30.23 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  30.23 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  30.23 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  30.23 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  28.47 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2524  transposase, IS4 family protein  34.07 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3622  transposase, IS4 family protein  34.07 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968819  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1726  transposase, IS4 family protein  34.07 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3094  transposase, IS4 family protein  34.07 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0335819  normal  0.853001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2047  transposase, IS4 family protein  34.07 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3631  transposase, IS4 family protein  34.07 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411326  normal  0.17845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4477  transposase, IS4 family protein  34.07 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.164245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3722  transposase, IS4 family protein  34.07 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0136631  hitchhiker  0.000781159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  34.06 
 
 		 278 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  31.67 
 
 		 274 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  31.67 
 
 		 274 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  30.08 
 
 		 274 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  30.08 
 
 		 274 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  30.08 
 
 		 274 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  30.08 
 
 		 274 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  28.89 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  30.08 
 
 		 274 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  30.08 
 
 		 274 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4117  transposase, IS4  28.12 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1734  transposase, IS4 family protein  28.46 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  30.08 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  29.06 
 
 		 278 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  29.06 
 
 		 278 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  29.06 
 
 		 278 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  29.06 
 
 		 278 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  29.06 
 
 		 278 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  29.06 
 
 		 278 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>