51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1385 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1385  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  206  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  67.44 
 
 
268 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  49.4 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  42.68 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  42.68 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  42.68 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  42.68 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  42.68 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  42.68 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  38.37 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  38.82 
 
 
274 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  36.05 
 
 
258 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  37.21 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.71 
 
 
281 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  37.21 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  37.21 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  37.21 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  37.21 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.71 
 
 
281 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.9 
 
 
281 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  39.08 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  37.93 
 
 
147 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  47.54 
 
 
267 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  47.54 
 
 
268 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  38.82 
 
 
277 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44 
 
 
281 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  36.59 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  40 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  36.59 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  36.59 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  36.59 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  36.59 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  36.59 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  36.59 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  36.59 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  36.59 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  47.62 
 
 
268 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  47.62 
 
 
268 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  37.23 
 
 
260 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  38.89 
 
 
272 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  40 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  40 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.88 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  38.27 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  38.27 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  38.27 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  40.48 
 
 
268 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  40.48 
 
 
268 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  39.29 
 
 
303 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  39.29 
 
 
303 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  39.29 
 
 
303 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>