61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2337 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0123  seryl-tRNA synthetase  64.43 
 
 		 500 aa  684    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2126  seryl-tRNA synthetase  72.11 
 
 		 502 aa  795    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2337  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 502 aa  1033    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000400797  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2658  seryl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 506 aa  597  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0089078  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0687  seryl-tRNA synthetase  33.46 
 
 		 514 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.224098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0127  seryl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 514 aa  282  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.15007 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1776  seryl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 514 aa  282  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1483  seryl-tRNA synthetase  33.2 
 
 		 522 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0041  seryl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 514 aa  268  2e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.481913  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3402  hypothetical protein  26.95 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00115154  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0167  hypothetical protein  26.63 
 
 		 311 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4419  hypothetical protein  26.44 
 
 		 308 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332149  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3635  hypothetical protein  25.65 
 
 		 326 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.069427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0751  prolyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 576 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0934  threonyl-tRNA synthetase  24.56 
 
 		 633 aa  48.9  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.026136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2272  hypothetical protein  21.09 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4393  hypothetical protein  23.4 
 
 		 301 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4109  hypothetical protein  23.78 
 
 		 326 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0753694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 		 637 aa  48.5  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0635  prolyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 		 568 aa  48.5  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.401523  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0530  hypothetical protein  22.46 
 
 		 324 aa  47.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1806  hypothetical protein  22.46 
 
 		 324 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4154  hypothetical protein  25.13 
 
 		 324 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3305  hypothetical protein  25.13 
 
 		 324 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.91985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4212  hypothetical protein  25.13 
 
 		 324 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  24.1 
 
 		 572 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 574 aa  47.4  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 644 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  23.27 
 
 		 643 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  23.97 
 
 		 572 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0982  prolyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 570 aa  45.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00893244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1125  prolyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 		 574 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0610859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 		 571 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5078  hypothetical protein  22.6 
 
 		 313 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0330  threonyl-tRNA synthetase  25.26 
 
 		 606 aa  45.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000295964  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  21.23 
 
 		 638 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0993  hypothetical protein  22.94 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.283253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 576 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  25.64 
 
 		 567 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  28.75 
 
 		 577 aa  45.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  23.04 
 
 		 571 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2220  prolyl-tRNA synthetase  22.8 
 
 		 595 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 		 577 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0574  prolyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 581 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0692  threonyl-tRNA synthetase  25.35 
 
 		 667 aa  44.3  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.86772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0892  prolyl-tRNA synthetase  23.53 
 
 		 571 aa  43.9  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2887  hypothetical protein  22.46 
 
 		 324 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0517  prolyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 		 581 aa  43.9  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801971 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2198  hypothetical protein  22.46 
 
 		 324 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0640  hypothetical protein  22.46 
 
 		 324 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0654  hypothetical protein  22.46 
 
 		 324 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2509  hypothetical protein  22.46 
 
 		 324 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137809  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0817  hypothetical protein  22.46 
 
 		 324 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0176  tRNA synthetase class II (G H P and S)  19.03 
 
 		 352 aa  43.9  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 576 aa  43.5  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 571 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  25.85 
 
 		 575 aa  43.5  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0611  threonyl-tRNA synthetase  24.06 
 
 		 609 aa  43.5  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.260291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  23.15 
 
 		 570 aa  43.5  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3538  threonyl-tRNA synthetase  21.94 
 
 		 648 aa  43.5  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.211804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 571 aa  43.5  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>