53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0041 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1776  seryl-tRNA synthetase  84.82 
 
 		 514 aa  913    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0127  seryl-tRNA synthetase  84.82 
 
 		 514 aa  916    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.15007 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1483  seryl-tRNA synthetase  72.74 
 
 		 522 aa  788    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0041  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 514 aa  1045    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.481913  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0687  seryl-tRNA synthetase  84.44 
 
 		 514 aa  913    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.224098  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2337  seryl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 502 aa  268  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000400797  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2658  seryl-tRNA synthetase  31.3 
 
 		 506 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0089078  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2126  seryl-tRNA synthetase  29.77 
 
 		 502 aa  243  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0123  seryl-tRNA synthetase  29.29 
 
 		 500 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5078  hypothetical protein  27.73 
 
 		 313 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0993  hypothetical protein  26.17 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.283253 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1096  hypothetical protein  26.15 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4419  hypothetical protein  27.32 
 
 		 308 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0167  hypothetical protein  29.53 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3402  hypothetical protein  27.5 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00115154  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2272  hypothetical protein  24.43 
 
 		 326 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5057  hypothetical protein  27.32 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264041  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4596  hypothetical protein  27.32 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5362  hypothetical protein  26.8 
 
 		 332 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2887  hypothetical protein  26.73 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2198  hypothetical protein  26.73 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0640  hypothetical protein  26.73 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0654  hypothetical protein  26.73 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2509  hypothetical protein  26.73 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137809  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0817  hypothetical protein  26.73 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0530  hypothetical protein  27.09 
 
 		 324 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4393  hypothetical protein  27.59 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1078  hypothetical protein  27.59 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0176  tRNA synthetase class II (G H P and S)  24.16 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5838  hypothetical protein  26.02 
 
 		 321 aa  67  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4212  hypothetical protein  25.74 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3305  hypothetical protein  25.74 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.91985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4154  hypothetical protein  25.74 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1806  hypothetical protein  26.9 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4109  hypothetical protein  26.9 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0753694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3635  hypothetical protein  26.9 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.069427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0186  hypothetical protein  25.76 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3794  hypothetical protein  25.13 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2527  hypothetical protein  26.32 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438656  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4123  hypothetical protein  24.62 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1717  hypothetical protein  26.32 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.496913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6021  hypothetical protein  23.74 
 
 		 302 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.817536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0532  tRNA synthetase class II (G H P and S)  25.98 
 
 		 282 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1575  hypothetical protein  24.47 
 
 		 298 aa  53.5  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.013122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1475  hypothetical protein  24.39 
 
 		 302 aa  52.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  23.69 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  22.4 
 
 		 438 aa  47  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  22 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0692  seryl-tRNA synthetase  21.91 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  24.52 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2257  seryl-tRNA synthetase  20.71 
 
 		 431 aa  43.9  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510223  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06242  seryl-tRNA synthetase  21.62 
 
 		 449 aa  43.9  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13316  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01077  seryl-tRNA synthetase  21.62 
 
 		 449 aa  43.9  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>