44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1096 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1096  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0993  hypothetical protein  91.03 
 
 		 313 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.283253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5078  hypothetical protein  87.82 
 
 		 313 aa  577  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3402  hypothetical protein  69.93 
 
 		 308 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00115154  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4419  hypothetical protein  68.58 
 
 		 308 aa  424  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332149  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5057  hypothetical protein  64.74 
 
 		 310 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264041  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4596  hypothetical protein  64.42 
 
 		 310 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0186  hypothetical protein  51.19 
 
 		 319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3794  hypothetical protein  49.49 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4123  hypothetical protein  50.17 
 
 		 302 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6021  hypothetical protein  48.12 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.817536  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1475  hypothetical protein  48.21 
 
 		 302 aa  285  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3635  hypothetical protein  49.64 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.069427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4212  hypothetical protein  48.57 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4154  hypothetical protein  48.57 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3305  hypothetical protein  48.57 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.91985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5362  hypothetical protein  49.46 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4109  hypothetical protein  49.64 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0753694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1806  hypothetical protein  48.57 
 
 		 324 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4393  hypothetical protein  48.21 
 
 		 301 aa  279  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5838  hypothetical protein  46 
 
 		 321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0530  hypothetical protein  47.5 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0817  hypothetical protein  45.63 
 
 		 324 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2509  hypothetical protein  45.63 
 
 		 324 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0654  hypothetical protein  45.63 
 
 		 324 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0640  hypothetical protein  45.63 
 
 		 324 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2198  hypothetical protein  45.63 
 
 		 324 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2887  hypothetical protein  45.63 
 
 		 324 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1717  hypothetical protein  46.31 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.496913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2527  hypothetical protein  45.97 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438656  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0167  hypothetical protein  42.7 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1078  hypothetical protein  39.51 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2272  hypothetical protein  41.2 
 
 		 326 aa  203  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1575  hypothetical protein  39.11 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.013122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0532  tRNA synthetase class II (G H P and S)  34.78 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187637 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0176  tRNA synthetase class II (G H P and S)  30.53 
 
 		 352 aa  86.3  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1483  seryl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 522 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0041  seryl-tRNA synthetase  26.15 
 
 		 514 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.481913  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0687  seryl-tRNA synthetase  25.19 
 
 		 514 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.224098  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1776  seryl-tRNA synthetase  25.19 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0127  seryl-tRNA synthetase  25.19 
 
 		 514 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.15007 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2658  seryl-tRNA synthetase  21.27 
 
 		 506 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0089078  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0123  seryl-tRNA synthetase  22.89 
 
 		 500 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2337  seryl-tRNA synthetase  23.21 
 
 		 502 aa  42.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000400797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>