65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0687 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0041  seryl-tRNA synthetase  84.44 
 
 		 514 aa  913    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.481913  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1483  seryl-tRNA synthetase  73.32 
 
 		 522 aa  789    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0687  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 514 aa  1044    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.224098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0127  seryl-tRNA synthetase  97.47 
 
 		 514 aa  1025    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.15007 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1776  seryl-tRNA synthetase  97.67 
 
 		 514 aa  1028    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2337  seryl-tRNA synthetase  33.46 
 
 		 502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000400797  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2126  seryl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 502 aa  251  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2658  seryl-tRNA synthetase  31.68 
 
 		 506 aa  249  6e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0089078  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0123  seryl-tRNA synthetase  29.96 
 
 		 500 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5078  hypothetical protein  26.67 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1096  hypothetical protein  25.19 
 
 		 312 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5057  hypothetical protein  28.35 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264041  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4419  hypothetical protein  27.69 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332149  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4596  hypothetical protein  28.35 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0167  hypothetical protein  29.08 
 
 		 311 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3402  hypothetical protein  28.65 
 
 		 308 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00115154  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0993  hypothetical protein  25.1 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.283253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0530  hypothetical protein  28.93 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5362  hypothetical protein  24.41 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2509  hypothetical protein  27.55 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2887  hypothetical protein  27.55 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2198  hypothetical protein  27.55 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0640  hypothetical protein  27.55 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0654  hypothetical protein  27.55 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0817  hypothetical protein  27.55 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0176  tRNA synthetase class II (G H P and S)  24.16 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4393  hypothetical protein  26.11 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4154  hypothetical protein  26.53 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3305  hypothetical protein  26.53 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.91985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4212  hypothetical protein  26.53 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3635  hypothetical protein  26.53 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.069427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1806  hypothetical protein  26.53 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4109  hypothetical protein  26.02 
 
 		 326 aa  67  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0753694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2272  hypothetical protein  21.89 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5838  hypothetical protein  26.26 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0186  hypothetical protein  25.87 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1078  hypothetical protein  26.6 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3794  hypothetical protein  24.87 
 
 		 302 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2527  hypothetical protein  26.18 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438656  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4123  hypothetical protein  25.39 
 
 		 302 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1717  hypothetical protein  26.32 
 
 		 354 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.496913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6021  hypothetical protein  23.83 
 
 		 302 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.817536  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06242  seryl-tRNA synthetase  23.53 
 
 		 449 aa  54.7  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13316  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01077  seryl-tRNA synthetase  23.53 
 
 		 449 aa  54.7  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1475  hypothetical protein  23.98 
 
 		 302 aa  52.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0532  tRNA synthetase class II (G H P and S)  26.6 
 
 		 282 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1575  hypothetical protein  23.63 
 
 		 298 aa  52  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.013122  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  26.36 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2535  seryl-tRNA synthetase  22 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0771698  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  24.66 
 
 		 425 aa  47.4  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  23.19 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  23.19 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  21.54 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  21.54 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  21.54 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  21.54 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  21.54 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  21.54 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  23.08 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2257  seryl-tRNA synthetase  20.23 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510223  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  21.15 
 
 		 433 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  22.94 
 
 		 433 aa  44.3  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  23.39 
 
 		 580 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1791  seryl-tRNA synthetase  21.95 
 
 		 470 aa  43.5  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.419973  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2755  seryl-tRNA synthetase  19.67 
 
 		 426 aa  43.5  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>