63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2658 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2658  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 506 aa  1042    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0089078  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2337  seryl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000400797  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2126  seryl-tRNA synthetase  54.71 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0123  seryl-tRNA synthetase  55.62 
 
 		 500 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1483  seryl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 522 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0041  seryl-tRNA synthetase  31.3 
 
 		 514 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.481913  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0127  seryl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 514 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.15007 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0687  seryl-tRNA synthetase  31.68 
 
 		 514 aa  249  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.224098  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1776  seryl-tRNA synthetase  30.92 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5362  hypothetical protein  25.32 
 
 		 332 aa  51.2  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0167  hypothetical protein  25.53 
 
 		 311 aa  51.2  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4109  hypothetical protein  26.06 
 
 		 326 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0753694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3635  hypothetical protein  25.27 
 
 		 326 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.069427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0176  tRNA synthetase class II (G H P and S)  19.4 
 
 		 352 aa  50.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0186  hypothetical protein  25.77 
 
 		 319 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4154  hypothetical protein  25.27 
 
 		 324 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4419  hypothetical protein  23.53 
 
 		 308 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332149  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4212  hypothetical protein  25.27 
 
 		 324 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3402  hypothetical protein  23.49 
 
 		 308 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00115154  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3305  hypothetical protein  25.27 
 
 		 324 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.91985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1806  hypothetical protein  25.81 
 
 		 324 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 641 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1717  hypothetical protein  24.66 
 
 		 354 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.496913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0934  threonyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 633 aa  47.8  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.026136  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4393  hypothetical protein  25.26 
 
 		 301 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0982  prolyl-tRNA synthetase  23.96 
 
 		 570 aa  47.4  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00893244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1873  threonyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 		 681 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0629809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2527  hypothetical protein  24.66 
 
 		 354 aa  47  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438656  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  25.44 
 
 		 575 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0892  prolyl-tRNA synthetase  23.21 
 
 		 571 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32096  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 		 647 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2272  hypothetical protein  26.71 
 
 		 326 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  25.12 
 
 		 635 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5838  hypothetical protein  24.03 
 
 		 321 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  25.84 
 
 		 572 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  24.82 
 
 		 636 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0316  seryl-tRNA synthetase  24.27 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.317147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1096  hypothetical protein  21.27 
 
 		 312 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 		 577 aa  44.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06231  threonyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 638 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  23.66 
 
 		 571 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 		 640 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06531  threonyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 638 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.218915  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 		 635 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 		 640 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 		 571 aa  44.3  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5078  hypothetical protein  20.38 
 
 		 313 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0006  threonyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 633 aa  43.9  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.999215  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 640 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4525  threonyl-tRNA synthetase  22.03 
 
 		 659 aa  43.5  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.082511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2746  threonyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 		 690 aa  43.5  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47981  mitochondrial threonyl tRNA synthetase  25.64 
 
 		 449 aa  43.5  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0811608 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 		 639 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 		 639 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 		 639 aa  43.5  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  26.19 
 
 		 644 aa  43.5  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 		 652 aa  43.5  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 640 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 		 639 aa  43.5  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4596  hypothetical protein  22.29 
 
 		 310 aa  43.5  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 		 639 aa  43.5  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  25.09 
 
 		 636 aa  43.5  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0635  prolyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 568 aa  43.1  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.401523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>