44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5078 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5078  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  648    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0993  hypothetical protein  89.78 
 
 		 313 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.283253 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1096  hypothetical protein  87.82 
 
 		 312 aa  577  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3402  hypothetical protein  70.95 
 
 		 308 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00115154  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4419  hypothetical protein  68.9 
 
 		 308 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332149  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5057  hypothetical protein  66.03 
 
 		 310 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264041  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4596  hypothetical protein  65.71 
 
 		 310 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3794  hypothetical protein  49.83 
 
 		 302 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4123  hypothetical protein  50.51 
 
 		 302 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0186  hypothetical protein  50.85 
 
 		 319 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6021  hypothetical protein  49.15 
 
 		 302 aa  292  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.817536  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4154  hypothetical protein  48.22 
 
 		 324 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4212  hypothetical protein  48.22 
 
 		 324 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3305  hypothetical protein  48.22 
 
 		 324 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.91985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3635  hypothetical protein  49.49 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.069427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1806  hypothetical protein  48.22 
 
 		 324 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1475  hypothetical protein  48.12 
 
 		 302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4109  hypothetical protein  49.49 
 
 		 326 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0753694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4393  hypothetical protein  48.77 
 
 		 301 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0817  hypothetical protein  48.29 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2509  hypothetical protein  48.29 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0654  hypothetical protein  48.29 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0640  hypothetical protein  48.29 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2198  hypothetical protein  48.29 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2887  hypothetical protein  48.29 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0530  hypothetical protein  48.42 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5362  hypothetical protein  48.92 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1717  hypothetical protein  47.65 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.496913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5838  hypothetical protein  45.52 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2527  hypothetical protein  46.64 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438656  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0167  hypothetical protein  43.62 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1078  hypothetical protein  39.86 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2272  hypothetical protein  42.14 
 
 		 326 aa  205  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1575  hypothetical protein  40.22 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.013122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0532  tRNA synthetase class II (G H P and S)  35.12 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187637 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0041  seryl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 514 aa  87.8  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.481913  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1483  seryl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0176  tRNA synthetase class II (G H P and S)  27.8 
 
 		 352 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0687  seryl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.224098  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1776  seryl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 514 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0127  seryl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 514 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.15007 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2337  seryl-tRNA synthetase  22.6 
 
 		 502 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000400797  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2658  seryl-tRNA synthetase  20.38 
 
 		 506 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0089078  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0123  seryl-tRNA synthetase  22.07 
 
 		 500 aa  42.7  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>