41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4123 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4123  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37266  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3794  hypothetical protein  93.05 
 
 
302 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6021  hypothetical protein  86.75 
 
 
302 aa  562  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.817536  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1475  hypothetical protein  82.78 
 
 
302 aa  529  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0186  hypothetical protein  65.2 
 
 
319 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2509  hypothetical protein  60.2 
 
 
324 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0654  hypothetical protein  60.2 
 
 
324 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0640  hypothetical protein  60.2 
 
 
324 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2198  hypothetical protein  60.2 
 
 
324 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2887  hypothetical protein  60.2 
 
 
324 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0817  hypothetical protein  60.2 
 
 
324 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0530  hypothetical protein  59.52 
 
 
324 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4109  hypothetical protein  58.16 
 
 
326 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0753694  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4393  hypothetical protein  58.5 
 
 
301 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3635  hypothetical protein  58.16 
 
 
326 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.069427  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4154  hypothetical protein  56.8 
 
 
324 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4212  hypothetical protein  56.8 
 
 
324 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3305  hypothetical protein  56.8 
 
 
324 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.91985  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1806  hypothetical protein  57.48 
 
 
324 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5838  hypothetical protein  55.22 
 
 
321 aa  359  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1717  hypothetical protein  54.25 
 
 
354 aa  352  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.496913  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2527  hypothetical protein  54.9 
 
 
354 aa  350  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438656  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5362  hypothetical protein  52.84 
 
 
332 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0993  hypothetical protein  50.51 
 
 
313 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.283253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5078  hypothetical protein  50.51 
 
 
313 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1096  hypothetical protein  50.17 
 
 
312 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0167  hypothetical protein  48.65 
 
 
311 aa  295  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3402  hypothetical protein  49.49 
 
 
308 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00115154  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5057  hypothetical protein  48.99 
 
 
310 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264041  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4596  hypothetical protein  48.99 
 
 
310 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4419  hypothetical protein  48.12 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1078  hypothetical protein  45.36 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2272  hypothetical protein  41.31 
 
 
326 aa  248  8e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1575  hypothetical protein  43.45 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.013122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0176  tRNA synthetase class II (G H P and S)  25.1 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0532  tRNA synthetase class II (G H P and S)  27.62 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.187637 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0041  seryl-tRNA synthetase  24.62 
 
 
514 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.481913  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1776  seryl-tRNA synthetase  25.91 
 
 
514 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1483  seryl-tRNA synthetase  24.24 
 
 
522 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0687  seryl-tRNA synthetase  25.39 
 
 
514 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.224098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0127  seryl-tRNA synthetase  24.24 
 
 
514 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.15007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>