43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2509 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0817  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2509  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0654  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0640  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  673    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2198  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2887  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  673    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0530  hypothetical protein  95.37 
 
 
324 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1806  hypothetical protein  82.72 
 
 
324 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4154  hypothetical protein  81.17 
 
 
324 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4212  hypothetical protein  81.17 
 
 
324 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3305  hypothetical protein  81.17 
 
 
324 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.91985  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3635  hypothetical protein  84.36 
 
 
326 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.069427  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4109  hypothetical protein  84.36 
 
 
326 aa  554  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0753694  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4393  hypothetical protein  83.28 
 
 
301 aa  534  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1717  hypothetical protein  66.99 
 
 
354 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.496913  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2527  hypothetical protein  65.69 
 
 
354 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438656  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0186  hypothetical protein  62.93 
 
 
319 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5838  hypothetical protein  64.97 
 
 
321 aa  411  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5362  hypothetical protein  62 
 
 
332 aa  408  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1475  hypothetical protein  60.54 
 
 
302 aa  394  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6021  hypothetical protein  61.22 
 
 
302 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.817536  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3794  hypothetical protein  60.2 
 
 
302 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4123  hypothetical protein  60.2 
 
 
302 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37266  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0167  hypothetical protein  49.19 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4419  hypothetical protein  50.7 
 
 
308 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332149  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5057  hypothetical protein  48.85 
 
 
310 aa  285  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264041  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4596  hypothetical protein  51.08 
 
 
310 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3402  hypothetical protein  48.95 
 
 
308 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00115154  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5078  hypothetical protein  48.29 
 
 
313 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1096  hypothetical protein  45.63 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0993  hypothetical protein  46.58 
 
 
313 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.283253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1078  hypothetical protein  44.59 
 
 
320 aa  252  8.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1575  hypothetical protein  43.4 
 
 
298 aa  239  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.013122  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2272  hypothetical protein  43.04 
 
 
326 aa  238  8e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0532  tRNA synthetase class II (G H P and S)  28.03 
 
 
282 aa  86.3  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.187637 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1483  seryl-tRNA synthetase  27.45 
 
 
522 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0176  tRNA synthetase class II (G H P and S)  27.95 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1776  seryl-tRNA synthetase  28.06 
 
 
514 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0687  seryl-tRNA synthetase  27.55 
 
 
514 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.224098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0127  seryl-tRNA synthetase  26.87 
 
 
514 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.15007 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0041  seryl-tRNA synthetase  26.73 
 
 
514 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.481913  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0123  seryl-tRNA synthetase  23.81 
 
 
500 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2337  seryl-tRNA synthetase  22.46 
 
 
502 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000400797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>