41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0123 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2126  seryl-tRNA synthetase  62.25 
 
 		 502 aa  665    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0123  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 500 aa  1023    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2337  seryl-tRNA synthetase  64.43 
 
 		 502 aa  684    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000400797  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2658  seryl-tRNA synthetase  55.62 
 
 		 506 aa  578  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0089078  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1483  seryl-tRNA synthetase  30 
 
 		 522 aa  236  8e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0687  seryl-tRNA synthetase  29.96 
 
 		 514 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.224098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0127  seryl-tRNA synthetase  29.96 
 
 		 514 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.15007 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1776  seryl-tRNA synthetase  30.35 
 
 		 514 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0041  seryl-tRNA synthetase  29.29 
 
 		 514 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.481913  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1806  hypothetical protein  26.46 
 
 		 324 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2527  hypothetical protein  26.74 
 
 		 354 aa  54.3  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438656  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3635  hypothetical protein  26.46 
 
 		 326 aa  54.3  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.069427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1717  hypothetical protein  27.46 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.496913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0530  hypothetical protein  24.87 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3305  hypothetical protein  25.93 
 
 		 324 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.91985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4154  hypothetical protein  25.93 
 
 		 324 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4212  hypothetical protein  25.93 
 
 		 324 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3402  hypothetical protein  25.15 
 
 		 308 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00115154  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1873  threonyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 		 681 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0629809 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4109  hypothetical protein  25.4 
 
 		 326 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0753694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0167  hypothetical protein  25.17 
 
 		 311 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4419  hypothetical protein  24.54 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332149  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2509  hypothetical protein  23.81 
 
 		 324 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0654  hypothetical protein  23.81 
 
 		 324 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0640  hypothetical protein  23.81 
 
 		 324 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2198  hypothetical protein  23.81 
 
 		 324 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2887  hypothetical protein  23.81 
 
 		 324 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0817  hypothetical protein  23.81 
 
 		 324 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5362  hypothetical protein  25.34 
 
 		 332 aa  48.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  26.23 
 
 		 637 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4393  hypothetical protein  24.21 
 
 		 301 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4525  threonyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 		 659 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.082511 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5838  hypothetical protein  24.62 
 
 		 321 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7257  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  27.1 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  24.59 
 
 		 636 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1896  threonyl-tRNA synthetase  23.12 
 
 		 650 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1981  threonyl-tRNA synthetase  23.12 
 
 		 650 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.387429  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  24.92 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1096  hypothetical protein  22.89 
 
 		 312 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1982  threonyl-tRNA synthetase  21.97 
 
 		 650 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.570096  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2196  threonyl-tRNA synthetase  25.64 
 
 		 640 aa  43.5  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>