21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2126 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2126  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 502 aa  1033    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2337  seryl-tRNA synthetase  72.11 
 
 		 502 aa  795    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000400797  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0123  seryl-tRNA synthetase  62.25 
 
 		 500 aa  665    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2658  seryl-tRNA synthetase  54.71 
 
 		 506 aa  593  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0089078  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1483  seryl-tRNA synthetase  31 
 
 		 522 aa  251  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0687  seryl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 514 aa  251  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.224098  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1776  seryl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 514 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0127  seryl-tRNA synthetase  29.01 
 
 		 514 aa  246  9e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.15007 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0041  seryl-tRNA synthetase  29.77 
 
 		 514 aa  243  6e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.481913  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3402  hypothetical protein  26.21 
 
 		 308 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00115154  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4419  hypothetical protein  24.32 
 
 		 308 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332149  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 		 637 aa  49.7  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0167  hypothetical protein  34.48 
 
 		 311 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4393  hypothetical protein  25.13 
 
 		 301 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0635  prolyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 568 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.401523  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0817  prolyl-tRNA synthetase  23.45 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5838  hypothetical protein  24.24 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4109  hypothetical protein  24.61 
 
 		 326 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0753694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 648 aa  44.3  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1078  hypothetical protein  25 
 
 		 320 aa  44.3  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2272  hypothetical protein  24.21 
 
 		 326 aa  44.3  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>