142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1483 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0687  seryl-tRNA synthetase  73.32 
 
 		 514 aa  806    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.224098  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0041  seryl-tRNA synthetase  72.74 
 
 		 514 aa  802    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.481913  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1483  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 522 aa  1065    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0127  seryl-tRNA synthetase  72.94 
 
 		 514 aa  804    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.15007 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1776  seryl-tRNA synthetase  72.94 
 
 		 514 aa  801    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2337  seryl-tRNA synthetase  33.2 
 
 		 502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000400797  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2658  seryl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 506 aa  274  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0089078  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2126  seryl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 502 aa  256  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0123  seryl-tRNA synthetase  30.13 
 
 		 500 aa  240  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5078  hypothetical protein  29.9 
 
 		 313 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0167  hypothetical protein  26.64 
 
 		 311 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4419  hypothetical protein  27.69 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332149  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1096  hypothetical protein  28.21 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3402  hypothetical protein  28.72 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00115154  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0817  hypothetical protein  27.67 
 
 		 324 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0530  hypothetical protein  27.8 
 
 		 324 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0993  hypothetical protein  27.69 
 
 		 313 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.283253 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2887  hypothetical protein  27.67 
 
 		 324 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2198  hypothetical protein  27.67 
 
 		 324 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0640  hypothetical protein  27.67 
 
 		 324 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0654  hypothetical protein  27.67 
 
 		 324 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2509  hypothetical protein  27.67 
 
 		 324 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137809  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5057  hypothetical protein  27.5 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264041  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5362  hypothetical protein  27.01 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4154  hypothetical protein  27.67 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3635  hypothetical protein  27.45 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.069427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4212  hypothetical protein  27.67 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4596  hypothetical protein  27.84 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3305  hypothetical protein  27.67 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.91985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1806  hypothetical protein  28.16 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5838  hypothetical protein  28.08 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2272  hypothetical protein  23.64 
 
 		 326 aa  76.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4109  hypothetical protein  26.96 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0753694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0176  tRNA synthetase class II (G H P and S)  25.83 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4393  hypothetical protein  26.44 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1078  hypothetical protein  28.22 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0186  hypothetical protein  26.42 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1717  hypothetical protein  27.32 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.496913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2527  hypothetical protein  27.32 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438656  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3794  hypothetical protein  24.24 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6021  hypothetical protein  25.39 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.817536  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0692  seryl-tRNA synthetase  21.99 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4123  hypothetical protein  24.24 
 
 		 302 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  23.72 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1475  hypothetical protein  25.74 
 
 		 302 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1575  hypothetical protein  22.58 
 
 		 298 aa  54.7  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.013122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2755  seryl-tRNA synthetase  20.2 
 
 		 426 aa  53.5  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2257  seryl-tRNA synthetase  21.84 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510223  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  23.81 
 
 		 426 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  23.81 
 
 		 426 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01077  seryl-tRNA synthetase  21.92 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06242  seryl-tRNA synthetase  21.92 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0532  tRNA synthetase class II (G H P and S)  25.12 
 
 		 282 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187637 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2353  seryl-tRNA synthetase  21.8 
 
 		 431 aa  51.6  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  20.79 
 
 		 430 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  20.79 
 
 		 430 aa  51.6  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  20.79 
 
 		 430 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  25 
 
 		 423 aa  50.8  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1417  seryl-tRNA synthetase  20.28 
 
 		 430 aa  50.4  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  21.55 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  21.55 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0839  seryl-tRNA synthetase  23 
 
 		 422 aa  49.3  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  20.6 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3335  seryl-tRNA synthetase  20.93 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  21.55 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  21.55 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  21.55 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  21.55 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1159  seryl-tRNA synthetase  20.91 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553122 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  22.13 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1036  seryl-tRNA synthetase  21.05 
 
 		 427 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1075  seryl-tRNA synthetase  20.27 
 
 		 429 aa  48.5  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0171622  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2772  seryl-tRNA synthetase  20.27 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  21.12 
 
 		 433 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  19.82 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0318  seryl-tRNA synthetase  21.51 
 
 		 430 aa  48.1  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.334857  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  21.48 
 
 		 428 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  21.48 
 
 		 428 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  21.03 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  22.09 
 
 		 427 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  19.82 
 
 		 428 aa  47.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  19.93 
 
 		 433 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  19.93 
 
 		 433 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  20.34 
 
 		 438 aa  47.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  19.06 
 
 		 430 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  19.06 
 
 		 430 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0953  seryl-tRNA synthetase  21.66 
 
 		 468 aa  47.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.37183 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  19.06 
 
 		 430 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1077  seryl-tRNA synthetase  19.06 
 
 		 430 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  19.06 
 
 		 430 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  19.06 
 
 		 430 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  19.06 
 
 		 430 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1519  hypothetical protein  23.21 
 
 		 434 aa  47.4  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.833428 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  19.06 
 
 		 430 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  19.06 
 
 		 430 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  19.06 
 
 		 430 aa  47  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1028  seryl-tRNA synthetase  19.06 
 
 		 430 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  19.06 
 
 		 430 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  19.06 
 
 		 430 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0968  seryl-tRNA synthetase  19.06 
 
 		 430 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>