More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0839 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0839  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
422 aa  867    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl017  seryl-tRNA synthetase  63.51 
 
 
422 aa  560  1e-158  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
424 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
427 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
424 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 
420 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
429 aa  402  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
424 aa  405  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
424 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
423 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
424 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
422 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  47.41 
 
 
422 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 
423 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
424 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
422 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
427 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  46.96 
 
 
422 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  47.2 
 
 
422 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  45.35 
 
 
438 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
425 aa  389  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
422 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
425 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
423 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
427 aa  389  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  45.35 
 
 
438 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  45.58 
 
 
438 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
427 aa  390  1e-107  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
425 aa  390  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
422 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
423 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
423 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
427 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  49.07 
 
 
427 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
435 aa  384  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
422 aa  379  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
432 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1503  seryl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
424 aa  378  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981154 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0440  seryl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
439 aa  379  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
427 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
433 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
433 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
433 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
433 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
433 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
433 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
427 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
417 aa  376  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
433 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
424 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
423 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
433 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
435 aa  374  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
426 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
423 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
423 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
433 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
431 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
431 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
423 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
431 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
425 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
427 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
421 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
469 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
434 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4028  seryl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
443 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
452 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
430 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
432 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf851  seryl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
424 aa  370  1e-101  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
427 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
430 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
430 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
428 aa  368  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
442 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
424 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  45.43 
 
 
427 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
426 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
433 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
430 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
427 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
430 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
430 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
433 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
435 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
425 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
438 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0114  seryl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
418 aa  365  1e-100  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  43.52 
 
 
433 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>