63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0127 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0687  seryl-tRNA synthetase  97.47 
 
 		 514 aa  1025    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.224098  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0041  seryl-tRNA synthetase  84.82 
 
 		 514 aa  916    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.481913  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1483  seryl-tRNA synthetase  72.94 
 
 		 522 aa  788    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0127  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 514 aa  1046    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.15007 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1776  seryl-tRNA synthetase  98.05 
 
 		 514 aa  1026    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2337  seryl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 502 aa  282  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000400797  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2658  seryl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 506 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0089078  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2126  seryl-tRNA synthetase  29.01 
 
 		 502 aa  246  9e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0123  seryl-tRNA synthetase  29.96 
 
 		 500 aa  233  5e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5078  hypothetical protein  26.67 
 
 		 313 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1096  hypothetical protein  25.19 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4419  hypothetical protein  27.69 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332149  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5057  hypothetical protein  28.87 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264041  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4596  hypothetical protein  28.87 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0167  hypothetical protein  29.59 
 
 		 311 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3402  hypothetical protein  28.65 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00115154  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0993  hypothetical protein  25.1 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.283253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0530  hypothetical protein  28.22 
 
 		 324 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5362  hypothetical protein  24.32 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0817  hypothetical protein  26.87 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2509  hypothetical protein  26.87 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0654  hypothetical protein  26.87 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0640  hypothetical protein  26.87 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2887  hypothetical protein  26.87 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2198  hypothetical protein  26.87 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2272  hypothetical protein  22.22 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4393  hypothetical protein  25.48 
 
 		 301 aa  67  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4154  hypothetical protein  25.87 
 
 		 324 aa  67  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3305  hypothetical protein  25.87 
 
 		 324 aa  67  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.91985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4212  hypothetical protein  25.87 
 
 		 324 aa  67  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1806  hypothetical protein  25.87 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3635  hypothetical protein  25.87 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.069427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4109  hypothetical protein  26.02 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0753694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5838  hypothetical protein  25.89 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0176  tRNA synthetase class II (G H P and S)  23.55 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0186  hypothetical protein  24.88 
 
 		 319 aa  62  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1078  hypothetical protein  25.89 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01077  seryl-tRNA synthetase  23.92 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06242  seryl-tRNA synthetase  23.92 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3794  hypothetical protein  24.75 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4123  hypothetical protein  24.24 
 
 		 302 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1475  hypothetical protein  24.38 
 
 		 302 aa  54.3  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2527  hypothetical protein  25.13 
 
 		 354 aa  53.9  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438656  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1717  hypothetical protein  25.26 
 
 		 354 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.496913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6021  hypothetical protein  22.73 
 
 		 302 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.817536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2535  seryl-tRNA synthetase  22.4 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0771698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  26.36 
 
 		 428 aa  50.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  23.98 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0532  tRNA synthetase class II (G H P and S)  25.12 
 
 		 282 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1575  hypothetical protein  23.08 
 
 		 298 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.013122  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  21.79 
 
 		 433 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  21.79 
 
 		 433 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  21.79 
 
 		 433 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  21.79 
 
 		 433 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  21.79 
 
 		 433 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  21.79 
 
 		 433 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  23.19 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  23.19 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  23.08 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  23.53 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2755  seryl-tRNA synthetase  20 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  21.4 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  22.32 
 
 		 423 aa  43.5  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>