45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4109 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1806  hypothetical protein  95.4 
 
 		 324 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3635  hypothetical protein  99.08 
 
 		 326 aa  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.069427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4109  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  673    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0753694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4212  hypothetical protein  92.94 
 
 		 324 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3305  hypothetical protein  92.94 
 
 		 324 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.91985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4154  hypothetical protein  92.94 
 
 		 324 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0530  hypothetical protein  83.13 
 
 		 324 aa  568  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0654  hypothetical protein  82.21 
 
 		 324 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0640  hypothetical protein  82.21 
 
 		 324 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2198  hypothetical protein  82.21 
 
 		 324 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2887  hypothetical protein  82.21 
 
 		 324 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2509  hypothetical protein  82.21 
 
 		 324 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137809  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0817  hypothetical protein  82.21 
 
 		 324 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4393  hypothetical protein  88.67 
 
 		 301 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1717  hypothetical protein  64.92 
 
 		 354 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.496913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2527  hypothetical protein  64.59 
 
 		 354 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438656  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0186  hypothetical protein  66.33 
 
 		 319 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5362  hypothetical protein  60.06 
 
 		 332 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5838  hypothetical protein  64.29 
 
 		 321 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1475  hypothetical protein  58.5 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6021  hypothetical protein  58.84 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.817536  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3794  hypothetical protein  58.16 
 
 		 302 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4123  hypothetical protein  58.16 
 
 		 302 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0167  hypothetical protein  48.06 
 
 		 311 aa  318  7.999999999999999e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5057  hypothetical protein  50.97 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264041  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3402  hypothetical protein  51.37 
 
 		 308 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00115154  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4596  hypothetical protein  50.65 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4419  hypothetical protein  51.03 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332149  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5078  hypothetical protein  49.49 
 
 		 313 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1096  hypothetical protein  48.48 
 
 		 312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0993  hypothetical protein  48.77 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.283253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1078  hypothetical protein  46.28 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1575  hypothetical protein  43.51 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.013122  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2272  hypothetical protein  40.68 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0532  tRNA synthetase class II (G H P and S)  31.44 
 
 		 282 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187637 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0176  tRNA synthetase class II (G H P and S)  27.07 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1483  seryl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 522 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1776  seryl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 514 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0687  seryl-tRNA synthetase  26.02 
 
 		 514 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.224098  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0041  seryl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.481913  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0127  seryl-tRNA synthetase  25.37 
 
 		 514 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.15007 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2658  seryl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 506 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0089078  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0123  seryl-tRNA synthetase  25.4 
 
 		 500 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2337  seryl-tRNA synthetase  23.78 
 
 		 502 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000400797  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2126  seryl-tRNA synthetase  24.61 
 
 		 502 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>