78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0839 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0839  pyrolysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 419 aa  864    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2086  pyrolysyl-tRNA synthetase  60.19 
 
 		 416 aa  500  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00625446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4858  tRNA synthetase class II (G H P and S)  37.73 
 
 		 279 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0027  Pyrrolysine-tRNA ligase  33.7 
 
 		 278 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00428  lysyl-tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  33.33 
 
 		 527 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.40959 
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 		 633 aa  50.4  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0031  hypothetical protein  30.26 
 
 		 120 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 436 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4121  lysyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1914  tRNA synthetase class II (D K and N)  28.85 
 
 		 302 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000371414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2490  hypothetical protein  26.35 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1397  Histidine--tRNA ligase  30.84 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000267418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0186  phenylalanyl-tRNA synthetase, alpha subunit  29.37 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0534122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4226  lysyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 		 500 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1496  lysyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 		 500 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1101  lysyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 		 500 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1292  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  28.83 
 
 		 513 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 491 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2054  histidyl-tRNA synthetase  26.72 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.526684  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3370  lysyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 505 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1456  lysyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 		 510 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.370095  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2054  tRNA synthetase class II (D K and N)  28.85 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  29.14 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4854  hypothetical protein  29.73 
 
 		 110 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13141  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  27.43 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0707893  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3050  lysyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 521 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1121  histidyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227645 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3127  lysyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.578616  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2839  O-phosphoseryl-tRNA synthetase  24.2 
 
 		 531 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0233011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 484 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 638 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00960  lysyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 		 510 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1496  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  29.63 
 
 		 493 aa  44.3  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 501 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1839  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  23.85 
 
 		 307 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000593972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1784  lysyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 		 520 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1409  lysyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 514 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0992  lysyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 500 aa  44.3  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1054  lysyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 514 aa  44.3  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 		 496 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2162  tRNA synthetase class II (D K and N)  27.88 
 
 		 305 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3620  lysyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 		 516 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3428  lysyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 509 aa  43.9  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904218 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  26.67 
 
 		 503 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  28.78 
 
 		 502 aa  43.9  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1764  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  28.43 
 
 		 301 aa  43.9  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.076019  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3164  tRNA synthetase class II (D K and N)  25.96 
 
 		 301 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0465087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1753  lysyl-tRNA synthetase-related protein  28.57 
 
 		 307 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1132  lysyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 500 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1489  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  24.84 
 
 		 462 aa  43.5  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 508 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 508 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 508 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 		 492 aa  43.1  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3419  lysyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.535831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3491  lysyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1501  lysyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 		 500 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 508 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1311  lysyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 		 500 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484413 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2723  lysyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 508 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1060  lysyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 		 499 aa  43.5  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.175669  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0827  lysyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81959  normal  0.0384226 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3196  lysyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0568381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3296  lysyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 508 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0873  lysyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2645  lysyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 508 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.929733  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 508 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3049  lysyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0195  lysyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 512 aa  43.5  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00927236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3614  lysyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.659377 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 499 aa  43.1  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2148  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  26.61 
 
 		 307 aa  43.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000938384  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0869  lysyl-tRNA synthetase-related protein  24 
 
 		 309 aa  43.1  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.584702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>