87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2086 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2086  pyrolysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
416 aa  857    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00625446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0839  pyrolysyl-tRNA synthetase  59.95 
 
 
419 aa  528  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4858  tRNA synthetase class II (G H P and S)  37.59 
 
 
279 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0027  Pyrrolysine-tRNA ligase  37.32 
 
 
278 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
633 aa  59.3  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1292  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  29.82 
 
 
513 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0031  hypothetical protein  34.15 
 
 
120 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0537  O-phosphoseryl-tRNA synthetase  26.06 
 
 
526 aa  55.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.79062 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4854  hypothetical protein  37.84 
 
 
110 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
413 aa  51.6  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1914  tRNA synthetase class II (D K and N)  31.73 
 
 
302 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000371414  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2839  O-phosphoseryl-tRNA synthetase  26.11 
 
 
531 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0233011 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0740  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  26.74 
 
 
501 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.276226  normal  0.967184 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1715  O-phosphoseryl-tRNA synthetase  22.29 
 
 
537 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.459872  normal  0.678096 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1489  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  22.88 
 
 
462 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0888  O-phosphoseryl-tRNA synthetase  22.29 
 
 
537 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1060  O-phosphoseryl-tRNA synthetase  24.31 
 
 
540 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.4323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2490  hypothetical protein  22.46 
 
 
304 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 
506 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0273  O-phosphoseryl-tRNA synthetase  23.78 
 
 
550 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1570  O-phosphoseryl-tRNA synthetase  22.29 
 
 
537 aa  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 
491 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 
499 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1076  histidyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 
408 aa  47.8  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0186  phenylalanyl-tRNA synthetase, alpha subunit  25.25 
 
 
486 aa  47.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0534122  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0619  lysyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 
480 aa  47  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0202309  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0006  threonyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 
633 aa  47  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.999215  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1729  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  24.46 
 
 
478 aa  47  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.842004  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0081  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  25.73 
 
 
501 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1178  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  26.16 
 
 
502 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0196  O-phosphoseryl-tRNA synthetase  21.71 
 
 
537 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.580055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1132  lysyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 
500 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13141  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  24.86 
 
 
335 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0707893  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2054  tRNA synthetase class II (D K and N)  29.81 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1077  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  24.75 
 
 
544 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.221509  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41016  predicted protein  25.23 
 
 
460 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3052  lysyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 
527 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1178  histidyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
496 aa  45.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.534741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4121  lysyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 
500 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0502  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  37.25 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0805  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  26.43 
 
 
501 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1642  lysyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 
498 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.573049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5248  lysyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 
519 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178625  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0538  lysyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 
498 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000249001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  24.82 
 
 
420 aa  45.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 
436 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2162  tRNA synthetase class II (D K and N)  29.81 
 
 
305 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  25.52 
 
 
526 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
507 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 
644 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1410  lysyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 
520 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
503 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0290  O-phosphoseryl-tRNA synthetase  20.11 
 
 
529 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  31.79 
 
 
491 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0048  lysyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
495 aa  44.3  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 
430 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3370  lysyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 
505 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234173  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1839  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  22.81 
 
 
307 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000593972  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06231  threonyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 
638 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06531  threonyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 
638 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.218915  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0787  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  26.36 
 
 
309 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  24.82 
 
 
638 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1496  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  26.32 
 
 
493 aa  43.9  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1397  Histidine--tRNA ligase  28.69 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000267418  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_772  lysyl-tRNA synthetase, truncated  25.56 
 
 
309 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2054  histidyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 
430 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.526684  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0934  threonyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 
633 aa  43.5  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.026136  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1364  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  23.18 
 
 
345 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1496  lysyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 
500 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1753  lysyl-tRNA synthetase-related protein  26.92 
 
 
307 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 
635 aa  43.9  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1101  lysyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 
500 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  29.87 
 
 
508 aa  43.9  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14551  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  22.73 
 
 
335 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2148  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  28.24 
 
 
307 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000938384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4226  lysyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 
500 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366371  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 
498 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 
420 aa  43.5  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2997  lysyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 
502 aa  43.5  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1094  phenylalanine--tRNA ligase  23.19 
 
 
340 aa  43.1  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000190965  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  21.38 
 
 
415 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00428  lysyl-tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  30.58 
 
 
527 aa  43.5  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.40959 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  24.46 
 
 
503 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 
424 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1167  seryl-tRNA synthetase  22.73 
 
 
427 aa  43.1  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0695975  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0657  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  23.29 
 
 
498 aa  43.1  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>