26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4858 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4858  tRNA synthetase class II (G H P and S)  100 
 
 		 279 aa  573  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0027  Pyrrolysine-tRNA ligase  57.91 
 
 		 278 aa  341  7e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0839  pyrolysyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 419 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2086  pyrolysyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 416 aa  198  9e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00625446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2631  threonyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 643 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 643 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1397  Histidine--tRNA ligase  31.73 
 
 		 424 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000267418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 647 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 		 596 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1030  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  26.75 
 
 		 328 aa  46.2  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 659 aa  45.4  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 633 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  26.09 
 
 		 419 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 428 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf176  phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit  25.28 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 		 1094 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 496 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13141  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  27.96 
 
 		 335 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0707893  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 648 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 645 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 641 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0006  threonyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 633 aa  43.5  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.999215  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2574  lysyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 		 489 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.159832  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 648 aa  43.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 		 495 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 647 aa  42  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>