148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0078 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0078  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
400 aa  767    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1829  major facilitator transporter  35.23 
 
 
388 aa  202  8e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1437  major facilitator transporter  34.69 
 
 
388 aa  178  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.483807  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
400 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  26.89 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  28.61 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  26.09 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  27.51 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  25.96 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  27.43 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3861  major facilitator transporter  26.59 
 
 
426 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00863555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  27.6 
 
 
426 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  27.35 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  26.11 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 
413 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  28.49 
 
 
434 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  28.86 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  21.83 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
426 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  28.07 
 
 
434 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  26.01 
 
 
402 aa  63.9  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  27.43 
 
 
426 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 
361 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0190  cyanate permease  24.44 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  25.96 
 
 
432 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  29.67 
 
 
403 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  23.73 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  28.11 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  23.33 
 
 
401 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5382  major facilitator transporter  34.05 
 
 
408 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  27.75 
 
 
436 aa  60.1  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  23.08 
 
 
401 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  23.08 
 
 
401 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  26.2 
 
 
416 aa  60.1  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 
428 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
401 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  30.36 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  30.72 
 
 
394 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  29.23 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  26.84 
 
 
409 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0090  major facilitator transporter  23.14 
 
 
429 aa  56.6  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  26.67 
 
 
409 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  27.1 
 
 
368 aa  56.2  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  24.72 
 
 
408 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
411 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  23.4 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  26.73 
 
 
409 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  26.3 
 
 
424 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  26.67 
 
 
409 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2714  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
429 aa  53.1  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  25.89 
 
 
408 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  23.88 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1347  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
410 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.258837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  27.38 
 
 
406 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  26.97 
 
 
401 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  26.42 
 
 
366 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  23.97 
 
 
419 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
413 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  32.56 
 
 
409 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0049  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
410 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4522  major facilitator transporter  30.94 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  24.2 
 
 
404 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
496 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  28.19 
 
 
404 aa  50.4  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  24.76 
 
 
434 aa  50.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  27.81 
 
 
456 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  22.09 
 
 
456 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  27.07 
 
 
413 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  21.99 
 
 
439 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 
397 aa  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  30.85 
 
 
459 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 
389 aa  49.7  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  25.72 
 
 
424 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  27.56 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  27.56 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0581  major facilitator transporter  22.75 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  21.9 
 
 
443 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  26.67 
 
 
433 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3400  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  20.91 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  23.58 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 
415 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  28.83 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  25 
 
 
426 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 
388 aa  47.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  23.72 
 
 
451 aa  47.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
437 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2202  major facilitator transporter  27.98 
 
 
420 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
399 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0819  cyanate permease  22.67 
 
 
395 aa  47  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  27.47 
 
 
395 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  27.57 
 
 
409 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 
389 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 
439 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32460  cyanate permease  24.58 
 
 
455 aa  46.6  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372453  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0372  putative cyanate transporter  24.27 
 
 
384 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.552261  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3265  cyanate transporter  24.44 
 
 
393 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3284  putative cyanate transporter  24.44 
 
 
393 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.464523  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>