More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf619 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf619  heat shock protein GrpE  100 
 
 
277 aa  556  1e-157  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  33.57 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  28.82 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  30.17 
 
 
208 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  30.39 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  32.45 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  36.36 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0368  co-chaperone GrpE  35.83 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.722414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  29.83 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  28.07 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  35.34 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  32.03 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  31.9 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1196  GrpE protein  31.67 
 
 
196 aa  72  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  31.25 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  28.75 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  31.86 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  25.14 
 
 
200 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  28.48 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  27.27 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  33.04 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  25.93 
 
 
193 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  28.83 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  29.38 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  26.21 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  27.22 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  28.83 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  27.11 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  26.71 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1459  GrpE protein  28.75 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  30.36 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  25.61 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  26.7 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  31.37 
 
 
213 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  24.57 
 
 
186 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2133  HSP70 family protein GrpE  29.24 
 
 
199 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0603928  normal  0.40294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  25.71 
 
 
192 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  24.57 
 
 
186 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  29.65 
 
 
191 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2372  GrpE protein  28.76 
 
 
201 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.919254  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  24.57 
 
 
189 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  27.97 
 
 
186 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  27.43 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  29.69 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  27.15 
 
 
189 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  27.85 
 
 
230 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  27.43 
 
 
190 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  27.85 
 
 
230 aa  63.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  30.54 
 
 
185 aa  63.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  28.21 
 
 
282 aa  63.2  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  33.64 
 
 
188 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  27.33 
 
 
217 aa  63.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  26.28 
 
 
211 aa  62.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  25.71 
 
 
198 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  31.03 
 
 
202 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  31.03 
 
 
202 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.88 
 
 
198 aa  62.8  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
188 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
188 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  24.5 
 
 
181 aa  62.4  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  28.57 
 
 
187 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  25.58 
 
 
192 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  27.27 
 
 
209 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
188 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
188 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
188 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
188 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  25.49 
 
 
181 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
188 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2457  GrpE protein  28.48 
 
 
204 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.23302  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  32.74 
 
 
204 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  29.13 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  24.34 
 
 
178 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  29.73 
 
 
200 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  31.54 
 
 
204 aa  62  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  27.93 
 
 
205 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  24.34 
 
 
178 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  28.57 
 
 
187 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  31.86 
 
 
195 aa  61.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  32.61 
 
 
189 aa  60.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  26.92 
 
 
171 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  26.92 
 
 
171 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  26.25 
 
 
186 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.73 
 
 
217 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  26.74 
 
 
184 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  28.83 
 
 
200 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  26.47 
 
 
194 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  26.77 
 
 
187 aa  60.1  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  35.2 
 
 
174 aa  59.7  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  25.9 
 
 
192 aa  59.7  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  29.31 
 
 
206 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  29.31 
 
 
206 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  29.31 
 
 
206 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  34.91 
 
 
231 aa  58.9  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  29.31 
 
 
206 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  22.71 
 
 
201 aa  58.9  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  28.22 
 
 
234 aa  58.9  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  27.59 
 
 
181 aa  58.9  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  25.88 
 
 
189 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  27.78 
 
 
210 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>