57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03456 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03456  11-domain light and oxygen sensing his kinase  100 
 
 		 271 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000206574  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 		 662 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 1300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 1291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 		 1258 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1995  putative PAS/PAC sensor protein  33.96 
 
 		 305 aa  112  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.447756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2922  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 415 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5778  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 402 aa  99.4  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2227  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.7 
 
 		 1275 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 810 aa  95.5  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1059  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  27.62 
 
 		 570 aa  92.8  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 681 aa  92.8  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 1042 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  27.54 
 
 		 1589 aa  87.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 1045 aa  87.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 1039 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 632 aa  86.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1570  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 383 aa  85.9  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1080  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 1128 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 657 aa  82  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 		 1384 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 960 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.19 
 
 		 1322 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4447  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.66 
 
 		 1878 aa  76.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.516196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 655 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 		 1042 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 525 aa  72.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 973 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 1359 aa  65.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 516 aa  63.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.2 
 
 		 1314 aa  60.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1231  histidine kinase  25 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000541094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02504  Signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 667 aa  53.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0812  putative PAS/PAC sensor protein  21.15 
 
 		 1543 aa  51.2  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000000129345 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2207  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  25.73 
 
 		 539 aa  50.4  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3773  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  24.16 
 
 		 394 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719874  normal  0.310272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2360  diguanylate cyclase  25.81 
 
 		 313 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0838  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.96 
 
 		 313 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 404 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  20.45 
 
 		 500 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1606  sensor histidine kinase  24.44 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4925  sensory box sensor histidine kinase  26.79 
 
 		 614 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 513 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 913 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 510 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 438 aa  45.8  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 510 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2328  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 518 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 514 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1661  AraC family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000279685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 1009 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.808539  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4219  hypothetical protein  24.31 
 
 		 166 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0280  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.4 
 
 		 314 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0265413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.32 
 
 		 1808 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1833  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 		 687 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 		 1309 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  25 
 
 		 463 aa  42.7  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>