More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2109 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2109  transcriptional regulator MerD  100 
 
 		 121 aa  239  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1212  transcriptional regulator MerD  77.48 
 
 		 121 aa  170  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4346  transcriptional regulator MerD  77.68 
 
 		 121 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0163  transcriptional regulator MerD  77.48 
 
 		 121 aa  170  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.450012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6494  transcriptional regulator MerD  82.46 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6175  transcriptional regulator MerD  82.46 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00228488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6184  transcriptional regulator MerD  82.46 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00899328  hitchhiker  0.000000958868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0105  transcriptional regulator MerD  82.46 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15450  transcriptional regulator MerD  82.46 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000354152  unclonable  4.51223e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2337  transcriptional regulator MerD  82.46 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.467691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0044  transcriptional regulator MerD  77.68 
 
 		 120 aa  149  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  0.308442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2134  transcriptional regulator MerD  77.68 
 
 		 120 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2227  MerR family transcriptional regulator  72.45 
 
 		 109 aa  136  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1788  mercuric resistence transcriptional repressor, MerD, MerR family  55.05 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32853  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4309  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  34.62 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  38.39 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  39.05 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  35.19 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 303 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 138 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  34.21 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  44.26 
 
 		 339 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  39.13 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01407  putative mercuric resistance operon coregulator  40 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 302 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  35.23 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  33.04 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  25.45 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 152 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  35.9 
 
 		 252 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  36.52 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  27.47 
 
 		 252 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  30.28 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  31 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  34.85 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.04 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  34.82 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  35.78 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  30.28 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  34.75 
 
 		 249 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 252 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 252 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  32.14 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  31.86 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  30.91 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  29.36 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  33.9 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 		 255 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  31.48 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  29.91 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  29.91 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  30.28 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>