71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2227 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2227  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  216  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0163  transcriptional regulator MerD  75.51 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.450012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4346  transcriptional regulator MerD  77.55 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1212  transcriptional regulator MerD  74.49 
 
 		 121 aa  137  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2109  transcriptional regulator MerD  72.45 
 
 		 121 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0105  transcriptional regulator MerD  79.59 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2337  transcriptional regulator MerD  79.59 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.467691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6494  transcriptional regulator MerD  79.59 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15450  transcriptional regulator MerD  79.59 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000354152  unclonable  4.51223e-22 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6184  transcriptional regulator MerD  79.59 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00899328  hitchhiker  0.000000958868 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6175  transcriptional regulator MerD  79.59 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00228488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0044  transcriptional regulator MerD  73.47 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  0.308442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2134  transcriptional regulator MerD  73.47 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1788  mercuric resistence transcriptional repressor, MerD, MerR family  60.19 
 
 		 120 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32853  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4309  MerR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01407  putative mercuric resistance operon coregulator  39.73 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  43.08 
 
 		 319 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  42.19 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  36.94 
 
 		 333 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 260 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  37.25 
 
 		 249 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 300 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  37.62 
 
 		 256 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 302 aa  43.5  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  37.8 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  42.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  35.45 
 
 		 254 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 		 264 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 		 303 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 250 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  32.32 
 
 		 254 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 186 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 319 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  32.5 
 
 		 143 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 256 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  34.09 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0951  transcriptional regulator, MerR family  26.32 
 
 		 159 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0159877  hitchhiker  0.00000555136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  37.66 
 
 		 155 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  34.09 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 250 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 162 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 137 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  33.78 
 
 		 159 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  32.29 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  34.57 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 252 aa  40.8  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 161 aa  40.8  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  34.57 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  31.91 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 254 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 138 aa  40  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  36.25 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 147 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>