179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01407 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01407  putative mercuric resistance operon coregulator  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4309  MerR family transcriptional regulator  55.47 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1788  mercuric resistence transcriptional repressor, MerD, MerR family  35.24 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32853  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  35.85 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  34.58 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4346  transcriptional regulator MerD  34.31 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0163  transcriptional regulator MerD  42.25 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.450012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1212  transcriptional regulator MerD  40.85 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2227  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  29.17 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  39.73 
 
 		 129 aa  50.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2109  transcriptional regulator MerD  40 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6494  transcriptional regulator MerD  45.61 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2337  transcriptional regulator MerD  45.61 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.467691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6175  transcriptional regulator MerD  45.61 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00228488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6184  transcriptional regulator MerD  45.61 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00899328  hitchhiker  0.000000958868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15450  transcriptional regulator MerD  45.61 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000354152  unclonable  4.51223e-22 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0105  transcriptional regulator MerD  45.61 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  33.75 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  34.07 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  31.25 
 
 		 449 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  32.38 
 
 		 252 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  39.24 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4570  regulatory protein MerR  28.36 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.7 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  30.28 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  28.41 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  36.62 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  38.46 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0044  transcriptional regulator MerD  42.11 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  0.308442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2134  transcriptional regulator MerD  42.11 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 151 aa  43.5  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  34.33 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  37.31 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  30.14 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  30.28 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.31 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  37.31 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  29.67 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  29.67 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 134 aa  42  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.21 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 134 aa  42  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 129 aa  42  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0478  regulatory protein MerR  31.08 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 134 aa  42  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 134 aa  42  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00394  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  33.33 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>