More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1788 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1788  mercuric resistence transcriptional repressor, MerD, MerR family  100 
 
 		 120 aa  239  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32853  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4346  transcriptional regulator MerD  58.93 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2109  transcriptional regulator MerD  55.05 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1212  transcriptional regulator MerD  72.73 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0163  transcriptional regulator MerD  72.73 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.450012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2337  transcriptional regulator MerD  74.65 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.467691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6494  transcriptional regulator MerD  74.65 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6175  transcriptional regulator MerD  74.65 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00228488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6184  transcriptional regulator MerD  74.65 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00899328  hitchhiker  0.000000958868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0105  transcriptional regulator MerD  74.65 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15450  transcriptional regulator MerD  74.65 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000354152  unclonable  4.51223e-22 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0044  transcriptional regulator MerD  56.88 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  0.308442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2134  transcriptional regulator MerD  56.88 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2227  MerR family transcriptional regulator  60.19 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4309  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  35.2 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01407  putative mercuric resistance operon coregulator  35.24 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  35.19 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  40.3 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  36.36 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  31.36 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 		 255 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  31.3 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  35.65 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  35.65 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  31.3 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  33.65 
 
 		 254 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  32.17 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  32.17 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  31.3 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  35.65 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  31.3 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  32.17 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  31.3 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  31.3 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  35.65 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  31.3 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  31.3 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  40.62 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  30.84 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  34.45 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 		 339 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  31.3 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 303 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  31.3 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  25.83 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  25.83 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.38 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 302 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  31.08 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  45.61 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  29.91 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  37.5 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  30.7 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  31.86 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  32.77 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  32.31 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  32.73 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>