231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4346 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4346  transcriptional regulator MerD  100 
 
 		 121 aa  235  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0163  transcriptional regulator MerD  88.43 
 
 		 121 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.450012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1212  transcriptional regulator MerD  87.6 
 
 		 121 aa  206  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6494  transcriptional regulator MerD  89.26 
 
 		 121 aa  187  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2337  transcriptional regulator MerD  89.26 
 
 		 121 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.467691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0105  transcriptional regulator MerD  89.26 
 
 		 121 aa  187  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6175  transcriptional regulator MerD  89.26 
 
 		 121 aa  187  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00228488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6184  transcriptional regulator MerD  89.26 
 
 		 121 aa  187  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00899328  hitchhiker  0.000000958868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15450  transcriptional regulator MerD  89.26 
 
 		 121 aa  187  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000354152  unclonable  4.51223e-22 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2109  transcriptional regulator MerD  77.68 
 
 		 121 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0044  transcriptional regulator MerD  82.64 
 
 		 120 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  0.308442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2134  transcriptional regulator MerD  82.64 
 
 		 120 aa  161  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2227  MerR family transcriptional regulator  77.55 
 
 		 109 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1788  mercuric resistence transcriptional repressor, MerD, MerR family  58.93 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32853  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4309  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  33.87 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01407  putative mercuric resistance operon coregulator  34.31 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  32.74 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  29.84 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  28.57 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  32.11 
 
 		 252 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  40.62 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 319 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  40.62 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  40.62 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 339 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 303 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  33.62 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  32.31 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  32.38 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 252 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  33.85 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  35.44 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  29.91 
 
 		 254 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 304 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  36.59 
 
 		 249 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 302 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1416  MerR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.185788  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  34.48 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  30.63 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 252 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  28.99 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 342 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.6 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 252 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  33.01 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  35.8 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0032  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 134 aa  42.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  38.6 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>