186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_15450 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6494  transcriptional regulator MerD  100 
 
 		 121 aa  235  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2337  transcriptional regulator MerD  100 
 
 		 121 aa  235  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.467691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6175  transcriptional regulator MerD  100 
 
 		 121 aa  235  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00228488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6184  transcriptional regulator MerD  100 
 
 		 121 aa  235  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00899328  hitchhiker  0.000000958868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15450  transcriptional regulator MerD  100 
 
 		 121 aa  235  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000354152  unclonable  4.51223e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0105  transcriptional regulator MerD  100 
 
 		 121 aa  235  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0163  transcriptional regulator MerD  91.74 
 
 		 121 aa  217  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.450012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1212  transcriptional regulator MerD  90.91 
 
 		 121 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4346  transcriptional regulator MerD  89.26 
 
 		 121 aa  209  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2109  transcriptional regulator MerD  82.46 
 
 		 121 aa  184  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2134  transcriptional regulator MerD  81.82 
 
 		 120 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0044  transcriptional regulator MerD  81.82 
 
 		 120 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  0.308442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2227  MerR family transcriptional regulator  79.59 
 
 		 109 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1788  mercuric resistence transcriptional repressor, MerD, MerR family  75.32 
 
 		 120 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32853  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4309  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01407  putative mercuric resistance operon coregulator  36.96 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  32.48 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  32.48 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  35.65 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  34.86 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  34.21 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1354  regulatory protein, MerR  38.2 
 
 		 333 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  40.62 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 319 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  25.69 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  34.69 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  35.92 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 303 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  40.98 
 
 		 339 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  37.31 
 
 		 252 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  34.92 
 
 		 249 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  33.67 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1311  MerR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 330 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.0692282 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  26.05 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 258 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  32.69 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  35.37 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1562  transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  35.37 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 		 302 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  27.88 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 252 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  46 
 
 		 304 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 254 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  34.33 
 
 		 319 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  30.28 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  39.13 
 
 		 256 aa  43.5  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  32.74 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 122 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 		 320 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  34.26 
 
 		 259 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  32.88 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 250 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  32.65 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  32.65 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0951  transcriptional regulator, MerR family  29.89 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0159877  hitchhiker  0.00000555136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  32.65 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  32.65 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  32.65 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  31.43 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>